241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1585 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1585  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 124 aa  237  5e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.772364  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  33.05 
 
 		 259 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 477 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 176 aa  50.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 99 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 422 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  39.51 
 
 		 193 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2889  DNA-binding protein  31.67 
 
 		 223 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  39.68 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2568  LacI family transcription regulator  31.67 
 
 		 223 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 218 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  36.63 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  41.27 
 
 		 175 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  31.17 
 
 		 467 aa  47.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 475 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2399  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  34.04 
 
 		 328 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 		 477 aa  47  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  37.18 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 210 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  48.21 
 
 		 190 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  41.82 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0336  DNA-binding protein, putative  37.35 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00628261  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  38.98 
 
 		 209 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4802  helix-turn-helix domain protein  41.07 
 
 		 233 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 220 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4243  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 229 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 209 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  29.47 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0908  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 397 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2812  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  37.5 
 
 		 338 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 197 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  34.52 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0807  XRE family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 506 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 204 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  44.07 
 
 		 251 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3072  XRE family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal  0.0716873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  37.33 
 
 		 187 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 223 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  32.91 
 
 		 469 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0683  XRE family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 239 aa  44.3  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1150  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.62 
 
 		 230 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000248041  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  44.83 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 423 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  29.87 
 
 		 474 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 292 aa  43.5  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  30.38 
 
 		 474 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_277  DNA-binding protein  38.67 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000765574  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3519  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 210 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 208 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  28.57 
 
 		 470 aa  43.5  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  41.27 
 
 		 192 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0172  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 428 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1786  helix-turn-helix transcriptional regulator  48.94 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 212 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 300 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 154 aa  42.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0422  transcriptional regulator  26.61 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0828  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 282 aa  42.7  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 428 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  46 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  40.26 
 
 		 215 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  30.86 
 
 		 371 aa  42.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  34.74 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4150  hypothetical protein  48.39 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  38.98 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 513 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1676  gp68  38.18 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4003  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4742  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0122495 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  37.29 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 779 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>