131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1676 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1676  gp68  100 
 
 		 155 aa  313  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610076  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 130 aa  96.3  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1786  helix-turn-helix transcriptional regulator  44.63 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5702  transcriptional regulator, XRE family  49.3 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4742  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0122495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1998  hypothetical protein  37.5 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503515  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0868  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 263 aa  71.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2542  XRE family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0893  XRE family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00171565  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0273  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 115 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2268  XRE family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3072  XRE family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal  0.0716873 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2413  helix-turn-helix domain-containing protein  34.75 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  36.84 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0571  transcriptional regulator, XRE family  36.96 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3278  hypothetical protein  35.04 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.397996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0556  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.4035 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  42.65 
 
 		 236 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  42.65 
 
 		 236 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0604  transcriptional regulator, XRE family  29.46 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  42.47 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 190 aa  48.5  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 193 aa  48.5  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1681  XRE family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 123 aa  48.5  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.527285 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 193 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 192 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 192 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 192 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 192 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 192 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 190 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  42.37 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 175 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1647  DNA-binding protein  27.35 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.68181  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  40.68 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  45.45 
 
 		 470 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  47.27 
 
 		 469 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  33.72 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6981  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 245 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0783  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 394 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.500633  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 197 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 474 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 199 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 227 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 263 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 227 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  37.7 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 60 aa  43.9  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 470 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3469  DNA-binding protein  37.1 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6209  hypothetical protein  46 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.280043  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4245  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 397 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  32.2 
 
 		 195 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  30.65 
 
 		 78 aa  43.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 470 aa  43.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  43.64 
 
 		 483 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1585  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.772364  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 195 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  46.81 
 
 		 182 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  41.82 
 
 		 140 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 224 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0405  transcriptional regulator, XRE family  31.18 
 
 		 123 aa  42.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267838  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 202 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3441  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 187 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.404086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5273  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  37.1 
 
 		 305 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 117 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 197 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 252 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1056  helix-turn-helix domain-containing protein  34.62 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3859  hypothetical protein  31.03 
 
 		 233 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4832  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0379  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.808324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 219 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 117 aa  41.6  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>