43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4243 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008738  Maqu_4243  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  461  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  44.62 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  44.62 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  40 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  30.28 
 
 		 244 aa  52.8  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  41.67 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  41.54 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  41.54 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  38.71 
 
 		 264 aa  49.3  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  38.71 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 433 aa  48.5  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  40 
 
 		 71 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4890  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 157 aa  46.6  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  37.7 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  36.51 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  36.25 
 
 		 154 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1585  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 124 aa  45.4  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.772364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 432 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  35.38 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  37.29 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  41.67 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0752  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 102 aa  43.5  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1733  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 133 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0465  XRE family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2567  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 106 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.59456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  35.53 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  35.53 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2042  transcriptional regulator  28.43 
 
 		 188 aa  43.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 106 aa  43.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  37.14 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  39.44 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  39.44 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  40.68 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 76 aa  42.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  40.68 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  32.81 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0098  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  30.19 
 
 		 305 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  35.53 
 
 		 154 aa  42  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1248  helix-turn-helix domain protein  36.62 
 
 		 109 aa  42  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000139831  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 129 aa  42  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>