240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4150 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4150  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  184  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  50 
 
 		 488 aa  56.2  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0924  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  38.57 
 
 		 323 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325541  normal  0.296459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  40.96 
 
 		 192 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4870  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 211 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.523431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2858  transcriptional regulator, XRE family  40.26 
 
 		 215 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000622832  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0734  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 223 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 191 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  46.03 
 
 		 191 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4657  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  36.49 
 
 		 305 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 187 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 490 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 199 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 478 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0868  XRE family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 263 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 504 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 191 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 504 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 171 aa  47.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  32.47 
 
 		 211 aa  47.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 227 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0877  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  36.62 
 
 		 317 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 191 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 199 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 191 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3519  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 		 210 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 490 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3602  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 488 aa  47  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 489 aa  47  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 218 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  42.86 
 
 		 489 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2399  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  35.21 
 
 		 328 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0273  transcriptional regulator, XRE family  45.28 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  36.05 
 
 		 223 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 248 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  29.87 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0188  XRE family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 229 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.054457 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2924  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 204 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.705469  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0364  phage repressor  40.26 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0378  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309443  hitchhiker  0.00198984 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3860  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.36 
 
 		 481 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2484  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0499056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  42.19 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  39.06 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  42.25 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1998  hypothetical protein  41.82 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503515  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3942  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 197 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 219 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1520  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0757766  normal  0.0239869 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 219 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 195 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1326  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  42.42 
 
 		 309 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783299  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  32.47 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  44.44 
 
 		 513 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 252 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1223  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  42.42 
 
 		 316 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117145  normal  0.0124179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 495 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1044  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  45.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0507985  normal  0.081223 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  39.39 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  42.42 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5702  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  37.88 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  34.12 
 
 		 215 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 176 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0746  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  34.29 
 
 		 306 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 197 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1786  helix-turn-helix transcriptional regulator  45.45 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1056  helix-turn-helix domain-containing protein  39.06 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  38.36 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2959  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676432  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1295  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 222 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 191 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 397 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0707  XRE family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  32.53 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  33.85 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>