More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0378 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0378  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
120 aa  237  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309443  hitchhiker  0.00198984 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  38.94 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 
112 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  33.02 
 
 
143 aa  53.9  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  38.46 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  34 
 
 
256 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3242  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  38.46 
 
 
185 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0746  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  27.72 
 
 
306 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248494  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 
69 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 
1143 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 
118 aa  50.8  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1248  DNA-binding protein  31.52 
 
 
137 aa  50.1  0.000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.821781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  39.06 
 
 
255 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  40.28 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  44.44 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  44.44 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  44.44 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  44.44 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  44.44 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  39.39 
 
 
72 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1555  transcriptional regulator  26.53 
 
 
181 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  38.03 
 
 
185 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  30.39 
 
 
233 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 
223 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  30 
 
 
233 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  31.07 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 
81 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  29.13 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  48.08 
 
 
182 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
255 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
192 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
191 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
191 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
192 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5273  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  30 
 
 
305 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
191 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6641  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  36.62 
 
 
342 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  28.45 
 
 
191 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  46.15 
 
 
182 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 
227 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  33.94 
 
 
355 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  30 
 
 
233 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 
71 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0278  XRE family transcriptional regulator  39.74 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0675  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  32.86 
 
 
297 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 
170 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 
193 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
156 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 
85 aa  47.4  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  32.63 
 
 
120 aa  47  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 
205 aa  47  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  30.7 
 
 
120 aa  47  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  31.46 
 
 
181 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 
66 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  30.39 
 
 
145 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  31.46 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
181 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  31.46 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2042  transcriptional regulator  34.48 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 
252 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 
71 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  27.27 
 
 
191 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  31.46 
 
 
181 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0877  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  29 
 
 
317 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0868  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 
263 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.471001  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 
71 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  30.77 
 
 
303 aa  45.4  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  31.46 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  35.48 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0459  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.995488  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0045  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00000742068  hitchhiker  0.0000000000614145 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 
191 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6198  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0687  XRE family transcriptional regulator  27.96 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0236581  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6981  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 
245 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 
101 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5225  XRE family transcriptional regulator  24.75 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4657  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  33.33 
 
 
305 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0473  XRE family transcriptional regulator  31.65 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  28.12 
 
 
327 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5293  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
81 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  31.46 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3923  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.680179  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4150  hypothetical protein  35.48 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5565  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
81 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0067  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
233 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  31.46 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0595  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.958783  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2104  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
174 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>