91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2675 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 422 aa  844    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  65.64 
 
 		 423 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3656  putative transcriptional regulator/TPR domain protein  57.42 
 
 		 421 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0423  transcriptional regulator/TPR domain protein, putative  23.56 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0668  transcriptional regulator, XRE family  22.12 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1433  hypothetical protein  33.71 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1699  hypothetical protein  33.71 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000791794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1315  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000145495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0636  transcriptional activator  26.1 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0425  transcriptional regulator  47.27 
 
 		 297 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.732449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4288  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 297 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.492783  normal  0.641627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1242  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0223131 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1013  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 297 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  39.39 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  39.39 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  39.39 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1058  transcriptional regulator  43.64 
 
 		 294 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.758834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1271  DNA-binding protein  43.64 
 
 		 294 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00018946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1239  DNA-binding protein  43.64 
 
 		 294 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1080  DNA-binding protein  43.64 
 
 		 294 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1212  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 298 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.295347  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1061  transcriptional regulator  43.64 
 
 		 294 aa  53.5  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000113559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 403 aa  53.9  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1163  DNA-binding protein  43.64 
 
 		 294 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4129  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 298 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  37.84 
 
 		 430 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  39.29 
 
 		 285 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  39.29 
 
 		 285 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2452  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 292 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2884  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 292 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.308835 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1747  transcriptional regulator, XRE family  29.55 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4934  transcriptional regulator, XRE family  31.65 
 
 		 487 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4702  transcriptional activator  25.74 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00084826 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  41.51 
 
 		 285 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  41.51 
 
 		 285 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5199  transcriptional regulator, PlcR  41.51 
 
 		 213 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  41.51 
 
 		 285 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3869  helix-turn-helix domain-containing protein  41.51 
 
 		 288 aa  50.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00219461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0512  XRE family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 419 aa  50.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2224  helix-turn-helix domain protein  22.87 
 
 		 403 aa  50.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.163485  hitchhiker  0.00213028 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3542  helix-turn-helix domain-containing protein  34.43 
 
 		 442 aa  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.518975  normal  0.855489 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  37.68 
 
 		 404 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5148  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 287 aa  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 209 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5479  putative transcriptional regulator PlcR  39.62 
 
 		 285 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000111873  hitchhiker  1.75075e-16 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1585  transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 		 124 aa  49.3  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.772364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0725  transcriptional activator  26.07 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  36.23 
 
 		 209 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  47.46 
 
 		 347 aa  49.3  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  38.81 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  40 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  40 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0514  helix-turn-helix domain-containing protein  37.33 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0924  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  37.84 
 
 		 323 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325541  normal  0.296459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9326  putative transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 452 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0335  helix-turn-helix domain protein  43.33 
 
 		 301 aa  47.8  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 403 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 176 aa  47.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0654  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000206988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3127  helix-turn-helix domain protein  34.85 
 
 		 434 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.641093  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  40.62 
 
 		 259 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0665  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 425 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0508  transcriptional activator (transcriptional regulator)  38.33 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0510  transcriptional activator (transcriptional regulator)  38.33 
 
 		 423 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.924451  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 184 aa  47.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  39.34 
 
 		 342 aa  47.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 403 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0566  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 422 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0597  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 422 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1748  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 404 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 112 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3404  XRE family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  37.33 
 
 		 210 aa  45.1  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1693  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 289 aa  45.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0267924  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  39.68 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  40.35 
 
 		 188 aa  45.8  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3185  transcriptional regulator, XRE family  26.8 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 76 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5721  hypothetical protein  29.41 
 
 		 431 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4546  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 140 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000650042  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  38.6 
 
 		 175 aa  43.9  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  40.68 
 
 		 387 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 215 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2571  helix-turn-helix domain protein  36.07 
 
 		 475 aa  43.5  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.576414  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 152 aa  43.5  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 219 aa  43.1  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  30.99 
 
 		 393 aa  43.1  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 505 aa  43.1  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>