34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3404 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3185  transcriptional regulator, XRE family  88.6 
 
 
421 aa  741    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3404  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
424 aa  852    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0115  hypothetical protein  47.53 
 
 
342 aa  249  6e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2224  helix-turn-helix domain protein  28.53 
 
 
403 aa  57.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.163485  hitchhiker  0.00213028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  24.67 
 
 
430 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4934  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 
487 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3542  helix-turn-helix domain-containing protein  29.11 
 
 
442 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.518975  normal  0.855489 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0134  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 
104 aa  49.3  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
68 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  38 
 
 
476 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1242  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 
432 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0223131 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 
68 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  26.8 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 
68 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 
68 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  48.15 
 
 
478 aa  47  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5721  hypothetical protein  36.47 
 
 
431 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0380907  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9326  putative transcriptional regulator, XRE family  34.52 
 
 
452 aa  46.6  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607046  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2843  transcriptional regulator, XRE family  52.27 
 
 
401 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0668  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
424 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  48.98 
 
 
142 aa  46.2  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3127  helix-turn-helix domain protein  45.1 
 
 
434 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.641093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  26.8 
 
 
422 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  46.94 
 
 
489 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  48.98 
 
 
126 aa  45.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40 
 
 
481 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 
205 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  41.07 
 
 
270 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  35.48 
 
 
91 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.979703 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
490 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0043  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
98 aa  43.5  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 
200 aa  43.5  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 
84 aa  43.5  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4630  transcriptional regulator, PbsX family  41.38 
 
 
94 aa  43.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>