127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1747 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1747  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
436 aa  867    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 
436 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1748  DNA-binding protein  27.44 
 
 
404 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  50.85 
 
 
403 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  50.85 
 
 
403 aa  63.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  50.85 
 
 
403 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  50.85 
 
 
403 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  50.85 
 
 
403 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  49.15 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  27.06 
 
 
403 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  27.52 
 
 
403 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  25.26 
 
 
285 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  25.53 
 
 
404 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  40.71 
 
 
199 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  40.71 
 
 
199 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  40.71 
 
 
199 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 
184 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  26.69 
 
 
285 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  25.84 
 
 
285 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  25.84 
 
 
285 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  25.93 
 
 
285 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2452  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 
292 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2884  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 
292 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.308835 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  34 
 
 
421 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  34 
 
 
421 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 
176 aa  53.9  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  47.46 
 
 
188 aa  53.5  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 
433 aa  53.5  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  26.22 
 
 
285 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  46.75 
 
 
240 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5199  transcriptional regulator, PlcR  37.8 
 
 
213 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  34.58 
 
 
432 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 
178 aa  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3869  helix-turn-helix domain-containing protein  38.57 
 
 
288 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00219461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 
422 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5479  putative transcriptional regulator PlcR  36.14 
 
 
285 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000111873  hitchhiker  1.75075e-16 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  34.02 
 
 
179 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0425  transcriptional regulator  44.44 
 
 
297 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.732449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  37.17 
 
 
199 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  47.46 
 
 
175 aa  50.8  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1013  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 
297 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1271  DNA-binding protein  42.59 
 
 
294 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00018946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1080  DNA-binding protein  42.59 
 
 
294 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1061  transcriptional regulator  42.59 
 
 
294 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000113559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1058  transcriptional regulator  42.59 
 
 
294 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.758834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1163  DNA-binding protein  42.59 
 
 
294 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0335  helix-turn-helix domain protein  32.67 
 
 
301 aa  50.8  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1315  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 
300 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000145495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1212  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 
298 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.295347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4129  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 
298 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4288  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 
297 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.492783  normal  0.641627 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1239  DNA-binding protein  42.59 
 
 
294 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0075  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 
73 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  33.67 
 
 
179 aa  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  33.67 
 
 
179 aa  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  49.15 
 
 
179 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  48.44 
 
 
207 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  28.41 
 
 
423 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 
300 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3127  helix-turn-helix domain protein  41.43 
 
 
434 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.641093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1554  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 
310 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5148  XRE family transcriptional regulator  34.44 
 
 
287 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 
73 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 
106 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  36.28 
 
 
199 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1419  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 
178 aa  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2222  DNA-binding protein  45.16 
 
 
179 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2474  XRE family transcriptional regulator  34.02 
 
 
267 aa  47.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  37.33 
 
 
179 aa  47.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1934  DNA-binding protein  45.16 
 
 
179 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0856  XRE family transcriptional regulator  28.92 
 
 
275 aa  47.4  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.609139  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2571  helix-turn-helix domain protein  43.4 
 
 
475 aa  47  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.576414  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 
165 aa  47  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0508  transcriptional activator (transcriptional regulator)  30.26 
 
 
423 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0510  transcriptional activator (transcriptional regulator)  30.26 
 
 
423 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.924451  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.2 
 
 
636 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  34.48 
 
 
181 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.36 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4838  transcriptional regulator, XRE family  28.26 
 
 
193 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0168811  hitchhiker  0.0000750229 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  34.48 
 
 
181 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  34.48 
 
 
181 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
181 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
181 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  20.17 
 
 
1238 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  34.48 
 
 
181 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 
252 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3096  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 
192 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00124629  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  38.75 
 
 
197 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 
181 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 
180 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 
435 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  34.48 
 
 
181 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  34.48 
 
 
181 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  34.48 
 
 
181 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2087  XRE family transcriptional regulator  37.65 
 
 
195 aa  44.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 
184 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  42.86 
 
 
184 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 
181 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0897  helix-turn-helix domain-containing protein  30.12 
 
 
296 aa  44.3  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354473  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 
490 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>