97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0807 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0807  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 506 aa  1031    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1217  XRE family transcriptional regulator  65.23 
 
 		 495 aa  566  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2895  XRE family transcriptional regulator  59.16 
 
 		 473 aa  520  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.406623 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  45.94 
 
 		 469 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2998  XRE family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 474 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  45.34 
 
 		 472 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 491 aa  395  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  43.47 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  43.04 
 
 		 470 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 461 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  44.64 
 
 		 461 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  44.42 
 
 		 464 aa  378  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 470 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  42.43 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  43.25 
 
 		 474 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  44.42 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  42.77 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 466 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 490 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  39.92 
 
 		 474 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  38.9 
 
 		 471 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 474 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  37.77 
 
 		 475 aa  321  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  39.87 
 
 		 486 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1365  hypothetical protein  40.59 
 
 		 477 aa  311  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4449  hypothetical protein  39.16 
 
 		 524 aa  306  8.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  0.892861 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  41.13 
 
 		 469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  39.03 
 
 		 481 aa  304  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  37.84 
 
 		 475 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  38.68 
 
 		 483 aa  303  4.0000000000000003e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2077  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 490 aa  302  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  40.13 
 
 		 484 aa  301  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1637  XRE family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 490 aa  300  4e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.375822 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 481 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  36.29 
 
 		 475 aa  299  7e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  36.8 
 
 		 474 aa  299  7e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  37.77 
 
 		 477 aa  299  9e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  36.67 
 
 		 482 aa  298  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  37.55 
 
 		 477 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 475 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  36.08 
 
 		 475 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 480 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  37.47 
 
 		 477 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1350  hypothetical protein  40.43 
 
 		 461 aa  294  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  37.39 
 
 		 466 aa  291  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  35.9 
 
 		 475 aa  290  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  36.15 
 
 		 480 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 483 aa  288  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  36.36 
 
 		 480 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  38.66 
 
 		 474 aa  287  2.9999999999999996e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 483 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 476 aa  279  7e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2007  transcriptional regulator, XRE family  39.83 
 
 		 471 aa  279  7e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464836  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 482 aa  279  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  34.84 
 
 		 476 aa  272  9e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 488 aa  271  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  37.98 
 
 		 461 aa  263  4.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  33.26 
 
 		 468 aa  253  5.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0218  transcriptional regulator, XRE family  38.72 
 
 		 455 aa  252  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.999471 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3158  transcriptional regulator, XRE family  35.81 
 
 		 472 aa  243  5e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  35.52 
 
 		 470 aa  243  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 474 aa  239  8e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 475 aa  238  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  33.56 
 
 		 467 aa  234  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2531  transcriptional regulator, XRE family  37.45 
 
 		 479 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 470 aa  233  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 470 aa  233  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0406  transcriptional regulator, XRE family  37.28 
 
 		 469 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157456 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  35.33 
 
 		 469 aa  229  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  33.26 
 
 		 483 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4189  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 491 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0115476  normal  0.171074 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0374  transcriptional regulator, XRE family  36.64 
 
 		 469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152873  decreased coverage  0.00046899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 463 aa  186  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0944  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 462 aa  179  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2985  DNA-binding protein  40.15 
 
 		 149 aa  114  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765892  normal  0.231078 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1405  transcriptional regulator  25.92 
 
 		 431 aa  91.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1471  helix-turn-helix domain-containing protein  26.14 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.772154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  22.48 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1510  XRE family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.899196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  22.93 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12303  hypothetical protein  20 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2696  XRE family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0198087  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  24.73 
 
 		 428 aa  57  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0172  transcriptional regulator  25.22 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  23.76 
 
 		 488 aa  52.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  22.85 
 
 		 490 aa  50.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  25.07 
 
 		 500 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  24.85 
 
 		 505 aa  47.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1585  transcriptional regulator, XRE family  30.38 
 
 		 124 aa  45.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.772364  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1353  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 88 aa  44.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000308869  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0683  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 239 aa  44.3  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 69 aa  43.9  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  32.93 
 
 		 188 aa  43.1  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>