137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0581 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  964    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 469 aa  359  5e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 491 aa  358  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  41.86 
 
 		 474 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  42.18 
 
 		 464 aa  350  5e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 		 477 aa  342  8e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 477 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 477 aa  341  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 471 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  41.09 
 
 		 477 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 461 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4449  hypothetical protein  42.8 
 
 		 524 aa  337  2.9999999999999997e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  0.892861 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  41.58 
 
 		 461 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  41.79 
 
 		 461 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  40.9 
 
 		 470 aa  334  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2998  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 474 aa  333  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  42.09 
 
 		 472 aa  332  8e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 490 aa  331  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  40.17 
 
 		 476 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 470 aa  329  5.0000000000000004e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  39.83 
 
 		 472 aa  329  7e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  42.37 
 
 		 464 aa  328  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  43.51 
 
 		 481 aa  327  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  40.25 
 
 		 477 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  38.03 
 
 		 475 aa  325  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  38.56 
 
 		 475 aa  323  5e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 475 aa  322  7e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  37.18 
 
 		 475 aa  322  7e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  39.02 
 
 		 466 aa  322  7e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  36.97 
 
 		 475 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  37.11 
 
 		 482 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2077  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 490 aa  319  7.999999999999999e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 474 aa  317  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  39.4 
 
 		 475 aa  315  8e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 470 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2895  XRE family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 473 aa  313  4.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.406623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  39.67 
 
 		 474 aa  312  6.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  37.84 
 
 		 474 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1217  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 495 aa  309  8e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1637  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.375822 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  38.64 
 
 		 486 aa  307  3e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0807  XRE family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 506 aa  305  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  38.68 
 
 		 466 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 480 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 483 aa  301  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  39.74 
 
 		 480 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 481 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1365  hypothetical protein  39.96 
 
 		 477 aa  300  5e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  39.74 
 
 		 480 aa  300  6e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 483 aa  298  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  41.47 
 
 		 469 aa  296  8e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  36.6 
 
 		 468 aa  294  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 483 aa  293  4e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1350  hypothetical protein  41.33 
 
 		 461 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 482 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2007  transcriptional regulator, XRE family  40.09 
 
 		 471 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464836  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 488 aa  287  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  37.21 
 
 		 474 aa  282  8.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0218  transcriptional regulator, XRE family  40.5 
 
 		 455 aa  270  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.999471 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  40.09 
 
 		 461 aa  264  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 		 475 aa  259  7e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 474 aa  248  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 464 aa  247  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  34.3 
 
 		 467 aa  245  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 476 aa  242  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 470 aa  239  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 470 aa  239  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  38.06 
 
 		 470 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2531  transcriptional regulator, XRE family  36.38 
 
 		 479 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  37.63 
 
 		 483 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  37.28 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0406  transcriptional regulator, XRE family  37.45 
 
 		 469 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157456 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3158  transcriptional regulator, XRE family  33.19 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0374  transcriptional regulator, XRE family  37.07 
 
 		 469 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152873  decreased coverage  0.00046899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4189  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 491 aa  203  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0115476  normal  0.171074 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0944  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 462 aa  201  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 463 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2985  DNA-binding protein  44.36 
 
 		 149 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765892  normal  0.231078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 490 aa  91.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1405  transcriptional regulator  25.11 
 
 		 431 aa  87  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  26.77 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1510  XRE family transcriptional regulator  27 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.899196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  25.32 
 
 		 478 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  25.51 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.06 
 
 		 481 aa  72  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  25.88 
 
 		 504 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  26.2 
 
 		 503 aa  70.1  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  25.7 
 
 		 488 aa  69.7  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  25.92 
 
 		 488 aa  66.6  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  26.64 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12303  hypothetical protein  21.83 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  27.44 
 
 		 505 aa  63.9  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0172  transcriptional regulator  26.43 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  24.82 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  24.93 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1471  helix-turn-helix domain-containing protein  30.48 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.772154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  22.11 
 
 		 496 aa  57.4  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  22.29 
 
 		 493 aa  54.7  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2696  XRE family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0198087  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1785  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00231258  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>