113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1737 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 493 aa  1006    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12303  hypothetical protein  57.23 
 
 		 491 aa  592  1e-168  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  40.24 
 
 		 496 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  40.69 
 
 		 500 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  35.15 
 
 		 505 aa  324  3e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1013  XRE family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 491 aa  286  8e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 490 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  22.68 
 
 		 476 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  22.83 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 482 aa  70.1  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4449  hypothetical protein  24.69 
 
 		 524 aa  68.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  0.892861 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  21.19 
 
 		 488 aa  67.4  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  21.02 
 
 		 480 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 483 aa  67  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  21.54 
 
 		 469 aa  66.6  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  23.87 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  21.44 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  21.24 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  21.44 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  20.61 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  23.09 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  20.25 
 
 		 474 aa  59.3  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  22.37 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 491 aa  58.2  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  21.89 
 
 		 474 aa  57.4  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  24.44 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  20.82 
 
 		 464 aa  57  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  23.09 
 
 		 504 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  19.24 
 
 		 482 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  22.74 
 
 		 470 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  19.92 
 
 		 475 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  22.49 
 
 		 461 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  22.31 
 
 		 461 aa  54.7  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  20.73 
 
 		 483 aa  53.5  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  20.62 
 
 		 475 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  20.62 
 
 		 475 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2998  XRE family transcriptional regulator  21.37 
 
 		 474 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  20.72 
 
 		 486 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  20.62 
 
 		 475 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  22.18 
 
 		 484 aa  51.2  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  21.62 
 
 		 472 aa  51.2  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 199 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  21.38 
 
 		 470 aa  50.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  21.06 
 
 		 461 aa  50.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  21.06 
 
 		 461 aa  50.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  22.56 
 
 		 475 aa  50.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  22.59 
 
 		 474 aa  50.1  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3851  XRE family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 510 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3944  XRE family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 510 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4059  XRE family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 510 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  20.9 
 
 		 463 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  21.02 
 
 		 477 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 182 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3903  transcriptional regulator, XRE family protein  22.3 
 
 		 511 aa  48.5  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  21.82 
 
 		 470 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  32.08 
 
 		 271 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  22.74 
 
 		 474 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  21.22 
 
 		 467 aa  48.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0106  XRE family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 509 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4239  transcriptional regulator, XRE family  22.77 
 
 		 510 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  20.53 
 
 		 474 aa  47.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4705  transcriptional regulator, putative  22.11 
 
 		 503 aa  47.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 101 aa  47.4  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 192 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  21.71 
 
 		 495 aa  47.4  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  39.34 
 
 		 175 aa  47.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  18.42 
 
 		 468 aa  47  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  28.99 
 
 		 260 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  40 
 
 		 200 aa  47  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 171 aa  46.6  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 284 aa  47  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 248 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  25 
 
 		 513 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4434  XRE family transcriptional regulator  21.75 
 
 		 509 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  28.99 
 
 		 192 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2077  transcriptional regulator, XRE family  21.41 
 
 		 490 aa  46.6  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 255 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 194 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 252 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  21.58 
 
 		 503 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3866  XRE family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 509 aa  45.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4294  XRE family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 259 aa  45.4  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 212 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 313 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  37.88 
 
 		 187 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  37.88 
 
 		 187 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  37.88 
 
 		 187 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 191 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 271 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  37.88 
 
 		 187 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  27.43 
 
 		 224 aa  44.3  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  37.88 
 
 		 187 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>