95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4631 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 271 aa  516  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  44.18 
 
 		 262 aa  192  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  46.33 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 273 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  46.31 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  42.23 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  46 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  42.02 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 261 aa  172  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 271 aa  172  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  41.57 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 313 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  45.34 
 
 		 265 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 272 aa  168  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 272 aa  168  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 288 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  43.93 
 
 		 273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  43.78 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  45.53 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 267 aa  158  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  40.65 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  40.08 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  39.69 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 244 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  41.06 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 287 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  39.59 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  43.51 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  39.02 
 
 		 288 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  40.41 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  35.36 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  31.27 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 281 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 345 aa  52.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  30.94 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3065  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  32.32 
 
 		 493 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  38.82 
 
 		 915 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2807  transcriptional regulator, XRE family  33.79 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  38.18 
 
 		 240 aa  47.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 107 aa  46.2  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 278 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3439  transcriptional regulator, XRE family  29.29 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0772  putative transcriptional regulator, XRE family  39.47 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 816 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12303  hypothetical protein  32.86 
 
 		 491 aa  43.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0675  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  31.3 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 182 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1786  helix-turn-helix transcriptional regulator  37.68 
 
 		 124 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 117 aa  42.7  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 106 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1896  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 512 aa  42.7  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 197 aa  42.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0930  helix-turn-helix domain-containing protein  34.23 
 
 		 297 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  38 
 
 		 149 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 142 aa  42.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 187 aa  42  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  37.25 
 
 		 245 aa  42  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>