117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3014 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 270 aa  535  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  79.1 
 
 		 244 aa  371  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  72.29 
 
 		 272 aa  357  8e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  72.29 
 
 		 272 aa  357  8e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  71.77 
 
 		 273 aa  346  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  57.59 
 
 		 274 aa  273  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  57.03 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 267 aa  251  9.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  53.67 
 
 		 267 aa  247  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  48.86 
 
 		 271 aa  245  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  49.41 
 
 		 264 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  51.9 
 
 		 273 aa  236  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  51.02 
 
 		 284 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  48.44 
 
 		 288 aa  234  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  50.19 
 
 		 315 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 264 aa  229  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  48.45 
 
 		 269 aa  228  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 261 aa  228  6e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 268 aa  228  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 282 aa  228  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 285 aa  226  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 282 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 273 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 282 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  51.43 
 
 		 271 aa  223  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 271 aa  221  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  48.12 
 
 		 273 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  51.05 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  46.46 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 287 aa  203  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 267 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  43.82 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  44.84 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  42.44 
 
 		 288 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  46.06 
 
 		 241 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  43.4 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  41.37 
 
 		 278 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  45.82 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  47.14 
 
 		 265 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  39.27 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 305 aa  165  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  36.98 
 
 		 285 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  38.28 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 294 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 277 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  37.4 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 241 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  35.87 
 
 		 318 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  36.08 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 280 aa  92  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 345 aa  62.4  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  27.54 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 84 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  39.06 
 
 		 79 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4035  transcriptional regulator, XRE family  31.44 
 
 		 326 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808008  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 802 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  39.06 
 
 		 79 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2269  helix-turn-helix domain-containing protein  56.41 
 
 		 48 aa  46.2  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 99 aa  45.8  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  33.8 
 
 		 99 aa  45.8  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 106 aa  45.4  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  40 
 
 		 73 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  40 
 
 		 73 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  40 
 
 		 73 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 84 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  40 
 
 		 73 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 99 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  40 
 
 		 73 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  40 
 
 		 73 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  29.27 
 
 		 223 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 106 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  25.76 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0695  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 101 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 73 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0773  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0622  hypothetical protein  31.25 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 131 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4413  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 121 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.465238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  32.22 
 
 		 476 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 145 aa  43.5  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>