86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5585 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 284 aa  555  1e-157  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  70.88 
 
 		 281 aa  360  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  69.8 
 
 		 265 aa  332  5e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 		 288 aa  289  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  58.82 
 
 		 241 aa  249  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  58.72 
 
 		 305 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  49.81 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  47.84 
 
 		 274 aa  228  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  48.98 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 272 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 272 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 282 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 282 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 282 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  47.04 
 
 		 282 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  46.72 
 
 		 284 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 282 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  44.84 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  44.86 
 
 		 262 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 285 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 310 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  45.85 
 
 		 306 aa  208  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 271 aa  208  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  47.35 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 271 aa  205  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 261 aa  202  5e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 264 aa  202  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  44.14 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 244 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  44.84 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 313 aa  192  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  44.18 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  44.96 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  45.8 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  44.03 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  42.56 
 
 		 273 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  39.76 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  37.93 
 
 		 270 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  44.25 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  43.51 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 277 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  37.05 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  36.43 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  35.58 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 281 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  32.56 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  34.19 
 
 		 318 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 263 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  31.85 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4196  transcriptional regulator, XRE family  30.89 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  34.78 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  40.74 
 
 		 90 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3065  helix-turn-helix domain protein  32.69 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1228  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 85 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2991  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 183 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3038  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 183 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2377  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 183 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2985  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 183 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3011  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 183 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6340  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 183 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2901  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 183 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0656  hypothetical protein  36.99 
 
 		 146 aa  43.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.449417  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  30.94 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1891  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 117 aa  42.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00988673  normal  0.0163804 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0455  helix-turn-helix domain-containing protein  43.1 
 
 		 84 aa  42.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.846585  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>