115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2129 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
264 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  62.55 
 
 
310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  63.6 
 
 
288 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  63.35 
 
 
284 aa  326  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  63.36 
 
 
315 aa  322  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  61.69 
 
 
282 aa  318  6e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  61.36 
 
 
282 aa  318  6e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  61.36 
 
 
282 aa  318  7e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  61.3 
 
 
282 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  61.3 
 
 
282 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  60.92 
 
 
282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  60.92 
 
 
282 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  61.57 
 
 
273 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  60.31 
 
 
306 aa  308  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  62.69 
 
 
267 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  60.98 
 
 
285 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  60.63 
 
 
271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  56.32 
 
 
268 aa  295  7e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  61.34 
 
 
273 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  60.16 
 
 
271 aa  291  7e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  59.76 
 
 
271 aa  289  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  57.69 
 
 
264 aa  285  5e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  57.81 
 
 
272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  57.81 
 
 
272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  61.02 
 
 
273 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  61.73 
 
 
264 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  55.22 
 
 
267 aa  281  7.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  56.98 
 
 
274 aa  280  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  54.79 
 
 
261 aa  278  6e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  52.9 
 
 
262 aa  276  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  53.91 
 
 
271 aa  274  9e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  56.64 
 
 
273 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  51.65 
 
 
313 aa  261  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  54.41 
 
 
267 aa  259  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  53.25 
 
 
275 aa  259  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  55.23 
 
 
273 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  50.97 
 
 
269 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  51.41 
 
 
244 aa  234  8e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  49.81 
 
 
284 aa  230  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  49.41 
 
 
270 aa  227  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 
288 aa  219  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  47.56 
 
 
278 aa  217  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  48.44 
 
 
281 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  50.4 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  52.48 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  45.42 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
287 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  48.74 
 
 
241 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  42.64 
 
 
270 aa  192  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  48.95 
 
 
305 aa  185  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  42.57 
 
 
283 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  41.37 
 
 
276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  43.43 
 
 
254 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  38.55 
 
 
302 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  45.49 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  40.45 
 
 
296 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  40.61 
 
 
281 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  41.57 
 
 
271 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  38.63 
 
 
318 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  40.07 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  36.96 
 
 
285 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  42.08 
 
 
241 aa  148  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  38.15 
 
 
272 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  38.15 
 
 
272 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  37.85 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  36.95 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  31.84 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  53.03 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  46.15 
 
 
91 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  44.64 
 
 
75 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0172  helix-turn-helix domain-containing protein  39.68 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2347  helix-turn-helix domain-containing protein  34.68 
 
 
304 aa  46.6  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 
106 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  35.71 
 
 
403 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  35.71 
 
 
403 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  35.71 
 
 
403 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  35.71 
 
 
403 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 
101 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 
404 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3542  helix-turn-helix domain-containing protein  35.38 
 
 
442 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.518975  normal  0.855489 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1040  transcriptional regulator, XRE family  46 
 
 
137 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119087 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  37.5 
 
 
404 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  35.71 
 
 
403 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2269  helix-turn-helix domain-containing protein  45.95 
 
 
48 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193733  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3195  transcriptional regulator, XRE family  35.8 
 
 
80 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0958967  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1554  XRE family transcriptional regulator  31.52 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4934  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 
487 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  44.78 
 
 
761 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9326  putative transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 
452 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607046  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5273  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  41.38 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  32.14 
 
 
149 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1326  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  40 
 
 
309 aa  43.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783299  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1223  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  41.54 
 
 
316 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117145  normal  0.0124179 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
191 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
191 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 
72 aa  43.5  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
191 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  37.93 
 
 
179 aa  42.7  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  32.14 
 
 
149 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>