75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4547 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 288 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  90.28 
 
 		 310 aa  508  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  77.58 
 
 		 315 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  70.25 
 
 		 282 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  68.82 
 
 		 282 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  69.18 
 
 		 282 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  68.82 
 
 		 282 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  68.46 
 
 		 282 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  68.82 
 
 		 282 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  68.1 
 
 		 282 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  63.6 
 
 		 264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  63.93 
 
 		 284 aa  315  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  59.21 
 
 		 306 aa  309  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 268 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  61 
 
 		 274 aa  306  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  59.54 
 
 		 267 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  59.85 
 
 		 285 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  60.16 
 
 		 271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  60.7 
 
 		 273 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  58.98 
 
 		 261 aa  298  8e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  62.35 
 
 		 267 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  54.02 
 
 		 271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  59.58 
 
 		 273 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  58.06 
 
 		 273 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  60.08 
 
 		 271 aa  273  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  59.67 
 
 		 271 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  61.15 
 
 		 264 aa  269  5e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  52.57 
 
 		 262 aa  268  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  53.14 
 
 		 272 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  53.14 
 
 		 272 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 267 aa  265  5.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  51.1 
 
 		 313 aa  263  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  54.18 
 
 		 275 aa  261  6.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  52.4 
 
 		 273 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  52.76 
 
 		 269 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  53.09 
 
 		 273 aa  247  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  48.24 
 
 		 288 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 287 aa  219  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  52 
 
 		 265 aa  219  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  46.95 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  48 
 
 		 281 aa  209  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  45.2 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  45.28 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  45.02 
 
 		 270 aa  199  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  48.56 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  47.08 
 
 		 241 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 281 aa  168  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  40.5 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  36.82 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  36.9 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  36.4 
 
 		 285 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 271 aa  159  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 294 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  39.41 
 
 		 318 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  39.69 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 272 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2269  helix-turn-helix domain-containing protein  60 
 
 		 48 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3542  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 442 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.518975  normal  0.855489 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0172  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 313 aa  43.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 211 aa  43.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  45.16 
 
 		 81 aa  42.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2593  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 116 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>