103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2725 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 272 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 272 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  97.05 
 
 		 273 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  72.29 
 
 		 270 aa  347  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  69.96 
 
 		 244 aa  321  8e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  59.63 
 
 		 274 aa  298  6e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  57.81 
 
 		 264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  61.51 
 
 		 275 aa  279  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  53.64 
 
 		 271 aa  278  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  55.98 
 
 		 273 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  54.2 
 
 		 310 aa  271  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 285 aa  271  7e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 		 284 aa  268  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  53.14 
 
 		 288 aa  268  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 267 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 282 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 282 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 306 aa  258  8e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  53.31 
 
 		 282 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  53.69 
 
 		 273 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 282 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  54.3 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 282 aa  255  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  52.92 
 
 		 282 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  52.92 
 
 		 282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  56.97 
 
 		 273 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 268 aa  247  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  52.19 
 
 		 264 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  54.58 
 
 		 267 aa  246  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  52.76 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  53.97 
 
 		 273 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  50.2 
 
 		 262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  55.02 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  54.62 
 
 		 271 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  50.58 
 
 		 267 aa  231  9e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  52.97 
 
 		 264 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 284 aa  217  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  49 
 
 		 288 aa  215  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 313 aa  205  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  44.53 
 
 		 281 aa  205  8e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  46 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  48.13 
 
 		 241 aa  195  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  44.03 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  50.6 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 277 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 254 aa  174  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  39.76 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 294 aa  165  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  39.78 
 
 		 296 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  38.55 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  43.6 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 281 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  35.91 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 241 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 318 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  37 
 
 		 297 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 201 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4035  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808008  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  38.57 
 
 		 75 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1766  helix-turn-helix domain protein  32.3 
 
 		 306 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1731  hypothetical protein  34.19 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  35.14 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 84 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  27.91 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  37.21 
 
 		 915 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 79 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7525  helix-turn-helix domain protein  34.19 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  40 
 
 		 91 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1326  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  44.64 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783299  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1223  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  44.64 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117145  normal  0.0124179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  30.87 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 131 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 76 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 76 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1228  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 85 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 211 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 131 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0868  XRE family transcriptional regulator  33 
 
 		 263 aa  43.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2924  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 204 aa  42.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.705469  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>