88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5749 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 287 aa  578  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  51.28 
 
 		 274 aa  260  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 282 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 282 aa  241  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  48.62 
 
 		 271 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 267 aa  239  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  46.06 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  47.95 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 310 aa  225  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  48.93 
 
 		 273 aa  223  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 315 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 273 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 306 aa  211  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 272 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 272 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  43.15 
 
 		 264 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  43.22 
 
 		 273 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  47.16 
 
 		 264 aa  206  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 267 aa  205  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 262 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  42.35 
 
 		 288 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  47.41 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  43.36 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  44.18 
 
 		 270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 		 284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  44.13 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  40.89 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  39.27 
 
 		 281 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  38.75 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  42.45 
 
 		 278 aa  190  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  44.49 
 
 		 241 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 265 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 244 aa  182  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  40.15 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  40.66 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 294 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  32.96 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 272 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 271 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  33.59 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  35.46 
 
 		 276 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  37.35 
 
 		 271 aa  142  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  32.09 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  32.23 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 201 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  33.98 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2269  helix-turn-helix domain-containing protein  47.62 
 
 		 48 aa  46.6  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1228  XRE family transcriptional regulator  48 
 
 		 85 aa  45.8  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 84 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  43.64 
 
 		 196 aa  43.9  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  39.51 
 
 		 194 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 106 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3860  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 151 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 477 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  28.26 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  39.06 
 
 		 488 aa  43.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  35.79 
 
 		 117 aa  42.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 1015 aa  42.7  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3261  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 190 aa  42.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 134 aa  42.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 259 aa  42.4  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>