76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0085 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 241 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  59.92 
 
 		 284 aa  278  8e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  66.8 
 
 		 305 aa  276  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  60.73 
 
 		 281 aa  273  1.0000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  60.17 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  52.61 
 
 		 288 aa  251  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  50.79 
 
 		 274 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  50.2 
 
 		 271 aa  231  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  49.39 
 
 		 262 aa  229  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  49.39 
 
 		 264 aa  225  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  49.6 
 
 		 272 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  49.6 
 
 		 272 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 313 aa  222  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  49 
 
 		 267 aa  215  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  50.84 
 
 		 275 aa  215  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  49.6 
 
 		 273 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 285 aa  215  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  45.34 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 273 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  50.21 
 
 		 273 aa  210  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 282 aa  208  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 264 aa  208  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  47.79 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 282 aa  205  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 282 aa  204  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  46.72 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 273 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 282 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 287 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 282 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  48.71 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  46.89 
 
 		 271 aa  198  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  44.98 
 
 		 269 aa  198  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  46.32 
 
 		 273 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  44.35 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  39.2 
 
 		 288 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  38.25 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  42.54 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  35.79 
 
 		 296 aa  148  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  35.37 
 
 		 276 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  36.18 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 302 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  39.92 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 281 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  32.41 
 
 		 285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 241 aa  131  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 254 aa  131  7.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  39 
 
 		 271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 297 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 272 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 263 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 280 aa  96.3  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 345 aa  68.9  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  27.72 
 
 		 757 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2363  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 117 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2503  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 117 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  29.59 
 
 		 131 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  27.5 
 
 		 377 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1891  transcriptional regulator, XRE family  35.85 
 
 		 117 aa  42.4  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00988673  normal  0.0163804 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 145 aa  42.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>