72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0588 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 264 aa  533  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  54.89 
 
 		 310 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  57.69 
 
 		 264 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  56.2 
 
 		 288 aa  292  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  57.87 
 
 		 282 aa  289  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  58.47 
 
 		 284 aa  287  9e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  55.43 
 
 		 315 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  57.09 
 
 		 282 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  57.09 
 
 		 282 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  57.09 
 
 		 282 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  57.09 
 
 		 282 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  56.69 
 
 		 282 aa  285  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  56.69 
 
 		 282 aa  285  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  55.73 
 
 		 261 aa  281  7.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  57.83 
 
 		 306 aa  280  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  54.96 
 
 		 285 aa  275  7e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  54.94 
 
 		 271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 268 aa  272  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  56.03 
 
 		 273 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  55.42 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  52.81 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  51.59 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  54.02 
 
 		 274 aa  265  7e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  54.62 
 
 		 267 aa  264  8.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  57.56 
 
 		 273 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  55.14 
 
 		 271 aa  264  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  54.73 
 
 		 271 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  49.8 
 
 		 262 aa  255  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  53.91 
 
 		 275 aa  253  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  52.19 
 
 		 272 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  52.19 
 
 		 272 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 267 aa  251  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  56.03 
 
 		 273 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  50.19 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  52.19 
 
 		 273 aa  248  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  49.61 
 
 		 269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  50.83 
 
 		 273 aa  231  7.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 244 aa  222  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  43.25 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 287 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  45.08 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  44.94 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  44.66 
 
 		 281 aa  199  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  42.15 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  46.64 
 
 		 241 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  42.34 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  40.71 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  39.19 
 
 		 296 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  38.22 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  38.15 
 
 		 276 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 294 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 302 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  33.07 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  35.63 
 
 		 318 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  35.25 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 915 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 761 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  35.19 
 
 		 149 aa  42  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>