88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2212 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 285 aa  558  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  73.33 
 
 		 306 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  70.36 
 
 		 284 aa  341  8e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  60.98 
 
 		 264 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  59.85 
 
 		 288 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  62.36 
 
 		 282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  61.71 
 
 		 282 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  61.25 
 
 		 282 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  62.65 
 
 		 271 aa  300  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  61.25 
 
 		 282 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  62.74 
 
 		 267 aa  299  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  62.65 
 
 		 271 aa  299  4e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  59.4 
 
 		 310 aa  299  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  60.84 
 
 		 315 aa  298  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  60.23 
 
 		 271 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  61.05 
 
 		 282 aa  295  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  61.45 
 
 		 273 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  61.28 
 
 		 282 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  60.22 
 
 		 282 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  57.85 
 
 		 268 aa  289  4e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  55.51 
 
 		 261 aa  281  7.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  58.33 
 
 		 274 aa  280  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  60.91 
 
 		 273 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  60.61 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 272 aa  271  7e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  55.16 
 
 		 271 aa  271  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 272 aa  271  7e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  53.26 
 
 		 262 aa  269  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  54.96 
 
 		 264 aa  268  7e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 273 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 267 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  53.41 
 
 		 275 aa  257  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  52.12 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  54.92 
 
 		 264 aa  250  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  52.63 
 
 		 273 aa  243  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  50.19 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  49.62 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  48.64 
 
 		 269 aa  225  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 244 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 287 aa  212  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  46.74 
 
 		 284 aa  209  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 281 aa  199  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  44.92 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  51.02 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  45.38 
 
 		 278 aa  195  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  43.73 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  48.58 
 
 		 241 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  43.91 
 
 		 254 aa  185  9e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 305 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  41.96 
 
 		 296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  39.58 
 
 		 318 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  36.69 
 
 		 283 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 302 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  41.33 
 
 		 271 aa  162  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  39.35 
 
 		 297 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 272 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 272 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  35.88 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  35.45 
 
 		 285 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 241 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 345 aa  65.5  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  41.07 
 
 		 75 aa  49.3  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  47.37 
 
 		 145 aa  47  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 84 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 761 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1460  molybdate metabolism transcriptional regulator  38.98 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  34.72 
 
 		 131 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4630  transcriptional regulator, PbsX family  47.27 
 
 		 94 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 106 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 84 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 76 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 131 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 76 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6164  hypothetical protein  43.64 
 
 		 132 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456474  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 71 aa  42.7  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 75 aa  42.7  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 72 aa  42.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  30.36 
 
 		 63 aa  42  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>