91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0736 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 288 aa  582  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  52.87 
 
 		 274 aa  270  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 267 aa  255  7e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 271 aa  238  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 306 aa  238  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  49.22 
 
 		 288 aa  238  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 285 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 273 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  46.18 
 
 		 282 aa  235  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  50.8 
 
 		 284 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  47.01 
 
 		 271 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  47.15 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 282 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  52.07 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 272 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 272 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  49.58 
 
 		 275 aa  222  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  44.36 
 
 		 269 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 261 aa  220  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  50.81 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  50.41 
 
 		 271 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 267 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  49.03 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  43.46 
 
 		 262 aa  206  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 244 aa  193  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 287 aa  192  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  40.87 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  39.69 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  38.35 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  41.56 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  46.31 
 
 		 265 aa  175  9e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  41.37 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  40.5 
 
 		 241 aa  168  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  38.67 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  40.56 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  36.98 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 254 aa  162  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  37.27 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  35.27 
 
 		 318 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  41.06 
 
 		 271 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  33.88 
 
 		 297 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 271 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 241 aa  102  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10023  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7511  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  47.37 
 
 		 145 aa  50.1  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 117 aa  49.3  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  44.64 
 
 		 232 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 84 aa  45.8  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4035  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 80 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 131 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 199 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  34.83 
 
 		 198 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 915 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2363  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 117 aa  43.9  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  34.09 
 
 		 223 aa  43.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 84 aa  43.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 192 aa  42.7  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  28.83 
 
 		 227 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 194 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 197 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2503  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 117 aa  42.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 478 aa  42  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 106 aa  42.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>