76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4027 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  590  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  80.9 
 
 		 296 aa  472  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  54.55 
 
 		 318 aa  285  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  53.71 
 
 		 297 aa  275  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  37.82 
 
 		 285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 302 aa  188  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  39 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 281 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 277 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  38.43 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  41 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  38.91 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 285 aa  176  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  41.91 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  37.64 
 
 		 271 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 315 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 282 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  38.11 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 282 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  39.03 
 
 		 270 aa  162  9e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 282 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  39 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  39.92 
 
 		 288 aa  158  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 273 aa  158  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 254 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  40.89 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  37.77 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  35.74 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  39.76 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 244 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  35.23 
 
 		 278 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  36.4 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  36.9 
 
 		 273 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 265 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  35.42 
 
 		 281 aa  135  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  35.88 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  32.08 
 
 		 288 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 280 aa  115  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  33.71 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7511  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 84 aa  45.8  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  47.17 
 
 		 145 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 		 761 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5273  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  39.66 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5476  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 199 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>