217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5476 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5476  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 290 aa  555  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0823  putative transcriptional regulator, XRE family  62.33 
 
 		 285 aa  291  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4196  transcriptional regulator, XRE family  58.68 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0208  XRE family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 277 aa  225  7e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.138367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  40.23 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  40.15 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  39.64 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  39.27 
 
 		 314 aa  135  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  39.16 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  40.14 
 
 		 287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  40.89 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  37.94 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  39.15 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  39.31 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  37.64 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  39.15 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  38.43 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  39.53 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  36.94 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 289 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 296 aa  122  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  37.97 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  38.91 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  38.55 
 
 		 307 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  38.13 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  40.14 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 289 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 299 aa  119  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 289 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  37.91 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  37.7 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  38.01 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  35.61 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  38.08 
 
 		 281 aa  115  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  36.59 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  35.42 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  38.6 
 
 		 297 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  38.3 
 
 		 293 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  37.22 
 
 		 294 aa  112  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  35.89 
 
 		 265 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  37.86 
 
 		 275 aa  112  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  36.96 
 
 		 299 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3299  helix-turn-helix domain protein  39.43 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.043491  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3700  transcriptional regulator, XRE family  37.06 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.564208  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  36.13 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  39.04 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  37.46 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  36.1 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  34.04 
 
 		 313 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  37.42 
 
 		 311 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 288 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  39.49 
 
 		 288 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  38.95 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  34.78 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  39.13 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3065  helix-turn-helix domain protein  37.23 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  35.57 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  39.49 
 
 		 289 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  36.99 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 299 aa  106  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  33.57 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  33.22 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  33.94 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  33.7 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  36.57 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  34.53 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4999  transcriptional regulator, XRE family  41.24 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.662496 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  35.92 
 
 		 282 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  36.72 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2718  helix-turn-helix domain protein  36.21 
 
 		 308 aa  102  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.479107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  45.19 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  35.07 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  49.64 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1956  putative transcriptional regulator, XRE family  37.59 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  33.96 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1431  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1269  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  33.1 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  30.83 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  34.81 
 
 		 273 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  35.33 
 
 		 287 aa  99.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2702  helix-turn-helix domain protein  36.62 
 
 		 284 aa  99.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  45.52 
 
 		 280 aa  99  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4035  transcriptional regulator, XRE family  36.3 
 
 		 326 aa  99  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808008  normal  0.21338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>