213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0682 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
292 aa  585  1e-166  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  62.28 
 
 
298 aa  342  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  61.35 
 
 
296 aa  340  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  61.35 
 
 
303 aa  339  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  62.11 
 
 
305 aa  334  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  60.55 
 
 
293 aa  333  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  60.21 
 
 
293 aa  329  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  60.68 
 
 
313 aa  328  7e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  59.3 
 
 
293 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  58.18 
 
 
299 aa  325  5e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  56.79 
 
 
287 aa  316  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  54.77 
 
 
294 aa  316  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  57.75 
 
 
297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  56.51 
 
 
297 aa  310  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  56.29 
 
 
304 aa  304  9.000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  52.4 
 
 
290 aa  290  3e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  57.86 
 
 
303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2718  helix-turn-helix domain protein  53.12 
 
 
308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.479107  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  55.4 
 
 
307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  54.06 
 
 
297 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  54.06 
 
 
304 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  50.49 
 
 
334 aa  280  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  53.71 
 
 
297 aa  278  7e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  51.42 
 
 
302 aa  276  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  49.13 
 
 
299 aa  270  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  52.8 
 
 
307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  49.82 
 
 
297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  47.26 
 
 
303 aa  252  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  47.67 
 
 
287 aa  243  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  49.3 
 
 
309 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  42.33 
 
 
302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  45.55 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  45.79 
 
 
293 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3299  helix-turn-helix domain protein  46.43 
 
 
280 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.043491  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 
301 aa  209  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 
310 aa  206  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  42.41 
 
 
303 aa  201  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  43.17 
 
 
302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  42.96 
 
 
292 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  44.65 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  44.4 
 
 
284 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 
317 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  46.35 
 
 
275 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  44.03 
 
 
282 aa  192  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  44.36 
 
 
282 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  41.09 
 
 
276 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  43.93 
 
 
314 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  43.73 
 
 
281 aa  183  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1995  transcriptional regulator, XRE family  42.81 
 
 
313 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000234374  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  41.97 
 
 
289 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  39.44 
 
 
299 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 
318 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  41.97 
 
 
289 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  41.97 
 
 
289 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  41.7 
 
 
291 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  40.93 
 
 
278 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  44.57 
 
 
288 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  44.57 
 
 
288 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  40.28 
 
 
286 aa  168  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  44.2 
 
 
289 aa  168  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 
291 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  41.33 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  39.86 
 
 
288 aa  163  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  40.67 
 
 
273 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  44.96 
 
 
277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  39.64 
 
 
307 aa  159  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  41.42 
 
 
342 aa  158  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  40.36 
 
 
265 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4329  transcriptional regulator, XRE family  40.57 
 
 
290 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  41.75 
 
 
298 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  37.55 
 
 
299 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  37.22 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 
284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  37.5 
 
 
277 aa  152  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  36.29 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  37.6 
 
 
278 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2579  helix-turn-helix domain protein  37.32 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  39.38 
 
 
291 aa  145  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  39.72 
 
 
285 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3700  transcriptional regulator, XRE family  37.69 
 
 
273 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.564208  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  36.58 
 
 
280 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  35.86 
 
 
295 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  37.74 
 
 
317 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  36.96 
 
 
280 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  39.86 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  38.28 
 
 
313 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  37.91 
 
 
300 aa  139  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  35.41 
 
 
259 aa  139  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  38.28 
 
 
257 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  37.11 
 
 
287 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  35.27 
 
 
276 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1956  putative transcriptional regulator, XRE family  39.75 
 
 
331 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  40.15 
 
 
285 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  34.73 
 
 
279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 
283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  34.43 
 
 
275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 
277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2807  transcriptional regulator, XRE family  35.77 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  37.07 
 
 
288 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  34.91 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>