213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3948 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  584  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  60.3 
 
 		 313 aa  338  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  59.07 
 
 		 317 aa  333  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  42.8 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  42.8 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  34.46 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  40.78 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  42.06 
 
 		 265 aa  189  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2702  helix-turn-helix domain protein  44.19 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  41.92 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  42.19 
 
 		 283 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  40.15 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3065  helix-turn-helix domain protein  41.54 
 
 		 276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1731  hypothetical protein  38.18 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1269  XRE family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 264 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4128  hypothetical protein  40.23 
 
 		 287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1066  helix-turn-helix domain-containing protein  37.17 
 
 		 289 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47890  hypothetical protein  38.87 
 
 		 314 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000556405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5170  XRE family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.624653  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  39.49 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1431  XRE family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 303 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0716  hypothetical protein  39.52 
 
 		 260 aa  169  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3367  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 278 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1162  XRE family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157815  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1766  helix-turn-helix domain protein  35.36 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  40.77 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7525  helix-turn-helix domain protein  40.15 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0930  helix-turn-helix domain-containing protein  38.75 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  36.46 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  39.46 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  40.15 
 
 		 307 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 285 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0038  helix-turn-helix domain protein  38.02 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2768  XRE family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  35.53 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1115  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4269  helix-turn-helix domain protein  36.4 
 
 		 279 aa  149  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0718578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  37.8 
 
 		 293 aa  149  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3211  XRE family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.663604  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  35.69 
 
 		 277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2182  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 274 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  36.94 
 
 		 292 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 276 aa  145  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 304 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  37.98 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 295 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5755  XRE family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 269 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  39.45 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 278 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  39 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  37.6 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  38.76 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  33.07 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0025  helix-turn-helix domain protein  37.64 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  39.45 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  37.13 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  35.69 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  39.62 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  37.25 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0023  XRE family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  35.58 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  36.43 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4035  transcriptional regulator, XRE family  38.28 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808008  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3414  XRE family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  36.72 
 
 		 287 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1066  transcriptional regulator, XRE family  39.11 
 
 		 270 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  37.11 
 
 		 292 aa  138  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  35.14 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  36.09 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  37.69 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3547  XRE family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3276  transcriptional regulator, XRE family  35.23 
 
 		 281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3598  transcriptional regulator, XRE family  35.98 
 
 		 281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 302 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  36.26 
 
 		 304 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  37.32 
 
 		 318 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4526  XRE family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  37.13 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2807  transcriptional regulator, XRE family  36.19 
 
 		 258 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>