225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4035 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4035  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 326 aa  632  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808008  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2377  transcriptional regulator, XRE family  60.51 
 
 		 283 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000201287  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3153  transcriptional regulator, XRE family  56.72 
 
 		 290 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6085  transcriptional regulator, XRE family  52.96 
 
 		 291 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.126069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4588  XRE family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 286 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000221272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  45.02 
 
 		 278 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  43.73 
 
 		 281 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  39.79 
 
 		 292 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2980  transcriptional regulator, XRE family  45.11 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.239716  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2024  putative transcriptional regulator, XRE family  42.91 
 
 		 286 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  41.67 
 
 		 285 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  39.56 
 
 		 278 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  41.03 
 
 		 287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1995  helix-turn-helix domain protein  40.98 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  39.93 
 
 		 280 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  37.87 
 
 		 277 aa  142  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2366  transcriptional regulator, XRE family  36.5 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  38.28 
 
 		 287 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2575  helix-turn-helix domain protein  36.24 
 
 		 280 aa  139  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1305  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4188  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4662  helix-turn-helix domain protein  39.8 
 
 		 287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  39.23 
 
 		 293 aa  133  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  38.79 
 
 		 278 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1333  transcriptional regulator, XRE family  36.8 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 289 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 289 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0700  transcriptional regulator, XRE family  36.19 
 
 		 279 aa  129  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3112  helix-turn-helix domain protein  38.66 
 
 		 279 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000518579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4999  transcriptional regulator, XRE family  36.82 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.662496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3573  helix-turn-helix domain-containing protein  39.71 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 279 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  38.32 
 
 		 309 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4173  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  36.4 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  35.9 
 
 		 310 aa  122  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  36.4 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1162  XRE family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157815  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  37.64 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4458  transcriptional regulator, XRE family  36.3 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  40.21 
 
 		 285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1062  XRE family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 289 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  36.7 
 
 		 286 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1700  helix-turn-helix domain protein  39.31 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  37.26 
 
 		 291 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  39.48 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  34.2 
 
 		 317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  34.95 
 
 		 302 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4040  helix-turn-helix domain protein  34.11 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557153  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  34.22 
 
 		 301 aa  115  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  28.24 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  34.63 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  33.66 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  36.33 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 285 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  33.98 
 
 		 283 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 285 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  35.42 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  34.06 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3904  transcriptional regulator, XRE family  37.46 
 
 		 284 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494464  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 284 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  36.53 
 
 		 282 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 285 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  35.38 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  36.82 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 		 313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2374  helix-turn-helix domain-containing protein  38.71 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.171601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  35.9 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  36.96 
 
 		 314 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  35.77 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 		 278 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  34.88 
 
 		 280 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  34.98 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  33.59 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4269  helix-turn-helix domain protein  35.58 
 
 		 279 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0718578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0716  hypothetical protein  34.06 
 
 		 260 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  36.5 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  38.27 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5170  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 280 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.624653  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  33.08 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  34.41 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  37.41 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  33.07 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3367  transcriptional regulator, XRE family  33.84 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  37.41 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>