215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0409 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 303 aa  609  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  61.45 
 
 		 314 aa  328  6e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  57.3 
 
 		 317 aa  321  9.000000000000001e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  56.83 
 
 		 286 aa  285  8e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  43.68 
 
 		 303 aa  215  9e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  45.65 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  44.53 
 
 		 291 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  44.02 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  43.26 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  42.41 
 
 		 292 aa  201  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  45.19 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  42.81 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  43.97 
 
 		 287 aa  198  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  42.7 
 
 		 302 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 312 aa  195  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  42.91 
 
 		 297 aa  195  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  42.11 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  44.77 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  40.99 
 
 		 294 aa  192  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  42.39 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  41.61 
 
 		 334 aa  192  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  41.99 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  40.71 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 285 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  40.78 
 
 		 304 aa  189  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  40.51 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  41.58 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  41.7 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  43.11 
 
 		 313 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  41.64 
 
 		 281 aa  185  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  41.61 
 
 		 284 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  41.34 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  42.49 
 
 		 297 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  40.79 
 
 		 273 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 304 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  42.09 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  45.08 
 
 		 284 aa  178  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  40.74 
 
 		 282 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 282 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  40.94 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  39.85 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1995  transcriptional regulator, XRE family  41.28 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000234374  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  39.05 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  38.52 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  39.04 
 
 		 299 aa  168  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  43.17 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4329  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  41.73 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  42.81 
 
 		 289 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  39.93 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2718  helix-turn-helix domain protein  39.31 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.479107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  42.21 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  35.51 
 
 		 276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3700  transcriptional regulator, XRE family  41.44 
 
 		 273 aa  162  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.564208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  38.93 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  43.15 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  40.56 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  38.16 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  35.09 
 
 		 277 aa  159  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  39.58 
 
 		 291 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  37.54 
 
 		 297 aa  158  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  40.14 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  41.4 
 
 		 278 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 307 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  38.31 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1956  putative transcriptional regulator, XRE family  39.37 
 
 		 331 aa  155  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  40 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  40.21 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  38.62 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3276  transcriptional regulator, XRE family  41.26 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  35.63 
 
 		 313 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  37.93 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  36.33 
 
 		 280 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3598  transcriptional regulator, XRE family  40.99 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  37.71 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0823  putative transcriptional regulator, XRE family  41.85 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  39.35 
 
 		 285 aa  146  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  35.74 
 
 		 301 aa  145  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  38.13 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4196  transcriptional regulator, XRE family  40.47 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3299  helix-turn-helix domain protein  41.42 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.043491  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  37.91 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3367  transcriptional regulator, XRE family  35.11 
 
 		 278 aa  142  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1431  XRE family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 303 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1162  XRE family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 281 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157815  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>