212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2980 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2980  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 271 aa  532  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.239716  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2377  transcriptional regulator, XRE family  47.71 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000201287  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4035  transcriptional regulator, XRE family  44.98 
 
 		 326 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808008  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4588  XRE family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 286 aa  185  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000221272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3153  transcriptional regulator, XRE family  43.66 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  44.36 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6085  transcriptional regulator, XRE family  41.11 
 
 		 291 aa  158  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.126069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  35.77 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  42.53 
 
 		 278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  39.33 
 
 		 287 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  37.31 
 
 		 281 aa  138  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  37.78 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  34.9 
 
 		 280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1305  XRE family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 287 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  38.78 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2024  putative transcriptional regulator, XRE family  36.54 
 
 		 286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3904  transcriptional regulator, XRE family  39.03 
 
 		 284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494464  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  36.65 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4662  helix-turn-helix domain protein  34.08 
 
 		 287 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4458  transcriptional regulator, XRE family  35.32 
 
 		 272 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  33.83 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  36.73 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1995  helix-turn-helix domain protein  35.77 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  38.17 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  35.69 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  36.09 
 
 		 282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  39.24 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  37.78 
 
 		 278 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  27.38 
 
 		 276 aa  118  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2210  putative transcriptional regulator, XRE family  37.17 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  32.71 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  36.57 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2366  transcriptional regulator, XRE family  32.33 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2374  helix-turn-helix domain-containing protein  38.55 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.171601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  35.02 
 
 		 302 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  33.09 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  35.8 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  32.23 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0700  transcriptional regulator, XRE family  31.56 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  33.94 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3700  transcriptional regulator, XRE family  36.98 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.564208  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  36.8 
 
 		 314 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2579  helix-turn-helix domain protein  35.38 
 
 		 328 aa  109  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  35.84 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 288 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  38.32 
 
 		 288 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  38.32 
 
 		 289 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3112  helix-turn-helix domain protein  34.93 
 
 		 279 aa  108  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000518579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4188  transcriptional regulator, XRE family  33.09 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1062  XRE family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 289 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  34.51 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  33.96 
 
 		 303 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 301 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  34.6 
 
 		 293 aa  104  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4999  transcriptional regulator, XRE family  31.44 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.662496 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  35.82 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  34.18 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  37.27 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  35.74 
 
 		 281 aa  102  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  32.72 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  35.11 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  31.9 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  33.47 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1269  XRE family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  33.1 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2575  helix-turn-helix domain protein  29.32 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3573  helix-turn-helix domain-containing protein  32.21 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1700  helix-turn-helix domain protein  36.22 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  34.66 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  32.23 
 
 		 297 aa  99.4  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1162  XRE family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 281 aa  99  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157815  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  32.55 
 
 		 313 aa  99  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  33.81 
 
 		 302 aa  99  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0930  helix-turn-helix domain-containing protein  31.91 
 
 		 297 aa  99  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 299 aa  98.2  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1431  XRE family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  33.57 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1956  putative transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  33.82 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7525  helix-turn-helix domain protein  32.45 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1333  transcriptional regulator, XRE family  30.27 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3367  transcriptional regulator, XRE family  30.91 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4040  helix-turn-helix domain protein  32.25 
 
 		 300 aa  95.9  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557153  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 263 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 263 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  35.17 
 
 		 257 aa  95.5  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3065  helix-turn-helix domain protein  32.97 
 
 		 276 aa  95.5  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4269  helix-turn-helix domain protein  31.68 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0718578  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>