214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2521 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 285 aa  553  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  55.02 
 
 		 273 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  44.25 
 
 		 291 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  42.44 
 
 		 278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  41.43 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  45.59 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  42.01 
 
 		 275 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  40.96 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  41.57 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 297 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  43.82 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  41.11 
 
 		 317 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  43.03 
 
 		 282 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  41.1 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  40.75 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 285 aa  149  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  40.14 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  37.41 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  39.16 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  39.35 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  40.28 
 
 		 334 aa  145  8.000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  39.72 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  38.64 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  40.07 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  40.07 
 
 		 303 aa  142  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 289 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  42.05 
 
 		 284 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  42.29 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  43.07 
 
 		 281 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  39.51 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  42.91 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  42.23 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  40.07 
 
 		 297 aa  138  7.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  37.68 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  38.55 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  37.16 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3700  transcriptional regulator, XRE family  37.36 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.564208  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  42.09 
 
 		 313 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  37.92 
 
 		 292 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  40.88 
 
 		 286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  38.38 
 
 		 304 aa  135  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  38 
 
 		 299 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  38.25 
 
 		 293 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  38.66 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  36.88 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  38.65 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  38.91 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  38.93 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7525  helix-turn-helix domain protein  35.55 
 
 		 294 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 312 aa  129  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 342 aa  128  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  38.99 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  36.4 
 
 		 280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  37.8 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1995  helix-turn-helix domain protein  35.98 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 301 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  40.23 
 
 		 300 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  36.69 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 276 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  37.71 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4458  transcriptional regulator, XRE family  37.73 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  38.41 
 
 		 287 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  36.19 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 263 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 263 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3299  helix-turn-helix domain protein  43.04 
 
 		 280 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.043491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1997  transcriptional regulator, XRE family  39.37 
 
 		 299 aa  122  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2182  XRE family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 270 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  38.61 
 
 		 291 aa  122  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  37.55 
 
 		 275 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  34.09 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  36.62 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  37.4 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2702  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  37.59 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  36.76 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  39.29 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5755  XRE family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 269 aa  118  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3414  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>