214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1003 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 291 aa  587  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  50.18 
 
 		 289 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  49.82 
 
 		 289 aa  242  7e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  49.82 
 
 		 289 aa  242  7e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  49.81 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 312 aa  232  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  47 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  49.22 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  43.96 
 
 		 294 aa  201  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4329  transcriptional regulator, XRE family  47.35 
 
 		 290 aa  199  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  43.07 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 299 aa  192  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  43.61 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  44.6 
 
 		 281 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  43.75 
 
 		 303 aa  186  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 301 aa  185  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  43.07 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  40.71 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  39.58 
 
 		 309 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  42.28 
 
 		 298 aa  175  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  45.64 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  42.75 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  41.16 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 285 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  42.16 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  40 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  41.33 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  42.26 
 
 		 293 aa  169  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 292 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  40.29 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  39.44 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  42.35 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  39.07 
 
 		 334 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  42.65 
 
 		 307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  40.07 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2579  helix-turn-helix domain protein  40.98 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  40.36 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 304 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  38.93 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  40.68 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  39.26 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  42.04 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  39.58 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  40 
 
 		 288 aa  158  8e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  39.27 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  41.01 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  40.07 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  39.86 
 
 		 280 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  43.63 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 279 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 277 aa  152  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  37.41 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  39.63 
 
 		 278 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3299  helix-turn-helix domain protein  42.16 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.043491  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  40.89 
 
 		 303 aa  146  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 288 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  38.49 
 
 		 314 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  36.55 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  38.15 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1995  transcriptional regulator, XRE family  40.21 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000234374  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  39.92 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  39.41 
 
 		 292 aa  138  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  39.44 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  35.47 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  38.41 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  35.52 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  36.46 
 
 		 287 aa  136  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  34.89 
 
 		 278 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  37.05 
 
 		 273 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  38.77 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  39.93 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  38.29 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  38.66 
 
 		 299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1956  putative transcriptional regulator, XRE family  36.24 
 
 		 331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  37.02 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  39.13 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0823  putative transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  39.77 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4526  XRE family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2718  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.479107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  35.11 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3700  transcriptional regulator, XRE family  36.96 
 
 		 273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.564208  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  35.61 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>