217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0180 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 288 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 288 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  97.92 
 
 		 289 aa  537  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  57.56 
 
 		 278 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  50.75 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  49.25 
 
 		 291 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  52.55 
 
 		 277 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  44.4 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  45.62 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  44.53 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  45.69 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  44.48 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  44.28 
 
 		 303 aa  195  9e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  44.53 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  46.34 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  44.89 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  44.57 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  44.57 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  42.6 
 
 		 317 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 314 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  42.05 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  43.77 
 
 		 293 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  43.17 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  44.57 
 
 		 292 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  44.57 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  43.68 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  43.8 
 
 		 286 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  42.91 
 
 		 293 aa  185  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  43.61 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  43.12 
 
 		 297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  45.38 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  41.73 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  43.97 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  41.94 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  40.94 
 
 		 276 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  41.09 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 		 318 aa  176  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3700  transcriptional regulator, XRE family  42.75 
 
 		 273 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.564208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  43.32 
 
 		 281 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  40.15 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  42.91 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  42.76 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  40.36 
 
 		 309 aa  169  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  43.32 
 
 		 298 aa  168  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 297 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  37.18 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  41.88 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  40.44 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  43.17 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  38.27 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  40.22 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  40.78 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  39.51 
 
 		 307 aa  161  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  44.09 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  41.15 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 289 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  37.55 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  37.79 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  42.86 
 
 		 285 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 289 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 289 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2718  helix-turn-helix domain protein  39.44 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.479107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  44.29 
 
 		 303 aa  155  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  36.03 
 
 		 303 aa  155  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  41.22 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  39.92 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  39 
 
 		 299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4329  transcriptional regulator, XRE family  40.81 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  38.55 
 
 		 288 aa  152  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  37.4 
 
 		 280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 263 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 263 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1731  hypothetical protein  37.23 
 
 		 296 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  40.82 
 
 		 280 aa  149  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2807  transcriptional regulator, XRE family  40.64 
 
 		 258 aa  149  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3299  helix-turn-helix domain protein  39.13 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.043491  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  42.49 
 
 		 278 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  41.22 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2024  putative transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  38.2 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3153  transcriptional regulator, XRE family  39.57 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  35.93 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0902  XRE family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 284 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1431  XRE family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 303 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>