212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6833 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 292 aa  587  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  50.35 
 
 		 285 aa  234  9e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  46.07 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  46.29 
 
 		 278 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2024  putative transcriptional regulator, XRE family  47.48 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2575  helix-turn-helix domain protein  43.77 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4662  helix-turn-helix domain protein  45.55 
 
 		 287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1333  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  43.06 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0700  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2366  transcriptional regulator, XRE family  40.86 
 
 		 279 aa  209  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  45.42 
 
 		 287 aa  209  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4188  transcriptional regulator, XRE family  42.55 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1305  XRE family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3112  helix-turn-helix domain protein  46.35 
 
 		 279 aa  206  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000518579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4173  transcriptional regulator, XRE family  41.61 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4040  helix-turn-helix domain protein  41.05 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557153  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2374  helix-turn-helix domain-containing protein  45.04 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.171601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4458  transcriptional regulator, XRE family  41.61 
 
 		 272 aa  192  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3573  helix-turn-helix domain-containing protein  42.7 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4999  transcriptional regulator, XRE family  42.49 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.662496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  42.91 
 
 		 278 aa  189  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2377  transcriptional regulator, XRE family  41.97 
 
 		 283 aa  185  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000201287  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1995  helix-turn-helix domain protein  41.67 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  43.56 
 
 		 285 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  40.71 
 
 		 278 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4035  transcriptional regulator, XRE family  40.29 
 
 		 326 aa  179  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808008  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  44.7 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1062  XRE family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 289 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3153  transcriptional regulator, XRE family  39.49 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  42.29 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  38.85 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 282 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4588  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000221272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  42.14 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  38.79 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  39.7 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 301 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6085  transcriptional regulator, XRE family  38.01 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.126069 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  37.68 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  40.22 
 
 		 314 aa  159  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  37.1 
 
 		 313 aa  158  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  37.59 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  38.69 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  38.77 
 
 		 275 aa  155  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  37.86 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  36.33 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  38.71 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2702  helix-turn-helix domain protein  38.38 
 
 		 284 aa  152  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  38.46 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  37.82 
 
 		 318 aa  152  7e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  37.86 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  38.27 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  40.29 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  36.33 
 
 		 282 aa  149  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  37.78 
 
 		 311 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 289 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 289 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  39.19 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  36.86 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  36.53 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  36 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  37.32 
 
 		 297 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  36.94 
 
 		 287 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  37.15 
 
 		 304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  38.24 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  30.04 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  38.6 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  39.49 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  38.16 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 285 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  39.05 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  37.23 
 
 		 307 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 279 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  38.61 
 
 		 280 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  34.8 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  36.86 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  39.41 
 
 		 291 aa  138  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1066  helix-turn-helix domain-containing protein  36.6 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 299 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2768  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  36.1 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2980  transcriptional regulator, XRE family  35.77 
 
 		 271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.239716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  39.08 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  33.86 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  37.92 
 
 		 285 aa  135  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1731  hypothetical protein  37.45 
 
 		 296 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>