212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7620 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 278 aa  549  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  46.29 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  48.07 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  46.76 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2377  transcriptional regulator, XRE family  47.25 
 
 		 283 aa  218  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000201287  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4035  transcriptional regulator, XRE family  45.02 
 
 		 326 aa  196  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808008  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  46.07 
 
 		 285 aa  195  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3153  transcriptional regulator, XRE family  44.74 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  42.45 
 
 		 280 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2024  putative transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  41.49 
 
 		 287 aa  188  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1305  XRE family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 287 aa  185  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4588  XRE family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000221272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4662  helix-turn-helix domain protein  42.29 
 
 		 287 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4458  transcriptional regulator, XRE family  39.56 
 
 		 272 aa  182  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  42.7 
 
 		 285 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6085  transcriptional regulator, XRE family  43.54 
 
 		 291 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.126069 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2575  helix-turn-helix domain protein  40.36 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4188  transcriptional regulator, XRE family  37.41 
 
 		 298 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0700  transcriptional regulator, XRE family  38.77 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 297 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2366  transcriptional regulator, XRE family  36.79 
 
 		 279 aa  171  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  41.88 
 
 		 303 aa  168  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1333  transcriptional regulator, XRE family  35.97 
 
 		 279 aa  168  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4999  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.662496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  41.45 
 
 		 311 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1062  XRE family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  42.28 
 
 		 278 aa  166  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  40.44 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  41.02 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3112  helix-turn-helix domain protein  40.73 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000518579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  40.07 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2980  transcriptional regulator, XRE family  44.28 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.239716  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  39.41 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4040  helix-turn-helix domain protein  38.71 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557153  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  41.03 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 317 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  39.58 
 
 		 299 aa  158  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  38.27 
 
 		 302 aa  158  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1995  helix-turn-helix domain protein  39.69 
 
 		 289 aa  158  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4173  transcriptional regulator, XRE family  36.73 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  42.8 
 
 		 297 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  37.59 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  40.88 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3573  helix-turn-helix domain-containing protein  39.15 
 
 		 281 aa  156  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  38.66 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  37.82 
 
 		 318 aa  152  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  37.89 
 
 		 280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  39.42 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  40.29 
 
 		 314 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  38.66 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2374  helix-turn-helix domain-containing protein  40.7 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.171601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  30.48 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  35.42 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  38.93 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  40.15 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  37.96 
 
 		 276 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  34.51 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  36.96 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  42.49 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  37.72 
 
 		 313 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  37.11 
 
 		 280 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  36.59 
 
 		 294 aa  142  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  37.09 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  38.21 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  42.12 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  34.9 
 
 		 313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  37.32 
 
 		 298 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  38.35 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  35.74 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  34.91 
 
 		 290 aa  135  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  35.02 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3065  helix-turn-helix domain protein  37.85 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4329  transcriptional regulator, XRE family  37.82 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  37.05 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  34.07 
 
 		 277 aa  132  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3700  transcriptional regulator, XRE family  37.27 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.564208  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  38.43 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  36.9 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  35.25 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  34.11 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  35.36 
 
 		 334 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  35.59 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0716  hypothetical protein  36.09 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  36.1 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  34.13 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  36.16 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 284 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>