217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7747 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 276 aa  547  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  46.18 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  43.17 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  41.3 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  42.7 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  42.18 
 
 		 294 aa  205  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  42.29 
 
 		 305 aa  205  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  42.86 
 
 		 303 aa  202  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  39.93 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  39.49 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  42.12 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  42.03 
 
 		 293 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  42.38 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  41.09 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  41.09 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  40.29 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 289 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  42.61 
 
 		 313 aa  189  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  40.29 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  39.35 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  39.86 
 
 		 334 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  39.05 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  41.09 
 
 		 292 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  40.22 
 
 		 293 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  42.29 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 304 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  38.35 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  39.64 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 317 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 297 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  37.28 
 
 		 303 aa  175  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  37.5 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  38.91 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  39.71 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  43.21 
 
 		 303 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  41.16 
 
 		 291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  40.73 
 
 		 307 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  42.49 
 
 		 278 aa  172  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  38.91 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2579  helix-turn-helix domain protein  39.34 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  40.42 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  40.29 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  42.24 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  39.93 
 
 		 291 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  36.73 
 
 		 318 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  40.94 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  40.15 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  40.94 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  35.51 
 
 		 303 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  38.41 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 278 aa  162  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  37.59 
 
 		 307 aa  159  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  38.82 
 
 		 280 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  41.16 
 
 		 298 aa  158  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  35.97 
 
 		 286 aa  158  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  32.81 
 
 		 276 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  37.16 
 
 		 291 aa  156  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 285 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  38.15 
 
 		 277 aa  155  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  39.93 
 
 		 281 aa  153  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  38.52 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  38.52 
 
 		 284 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1995  transcriptional regulator, XRE family  38.27 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000234374  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4329  transcriptional regulator, XRE family  40.22 
 
 		 290 aa  151  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  37.01 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  34.56 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  35.36 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1997  transcriptional regulator, XRE family  41.76 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  39.78 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 283 aa  147  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  34.69 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  36.53 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 285 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 285 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  39.31 
 
 		 277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2718  helix-turn-helix domain protein  37.89 
 
 		 308 aa  145  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.479107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  38.15 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3367  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1956  putative transcriptional regulator, XRE family  36.56 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4188  transcriptional regulator, XRE family  37.36 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  36.61 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  40.07 
 
 		 285 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  38.95 
 
 		 265 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 289 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 285 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  37.16 
 
 		 283 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>