215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1586 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 317 aa  637    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  57.8 
 
 		 314 aa  321  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  57.3 
 
 		 303 aa  321  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  48.23 
 
 		 286 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  45.25 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  44.1 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  40.78 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  42.6 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  41.3 
 
 		 294 aa  195  9e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  43.66 
 
 		 284 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 292 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  42.03 
 
 		 287 aa  192  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  40.71 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 285 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  39.15 
 
 		 278 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  40.22 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  41.16 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  41.97 
 
 		 298 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  41.05 
 
 		 313 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  36.94 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  39.49 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 284 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  42.11 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  39.35 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  39.1 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  40.41 
 
 		 291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  40.94 
 
 		 293 aa  179  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  41.11 
 
 		 273 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  39.86 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  39.78 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 276 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  42.6 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  38.06 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  42.34 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  42.24 
 
 		 289 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  40.64 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  41.38 
 
 		 277 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  41.33 
 
 		 291 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  39.86 
 
 		 318 aa  169  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4329  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  39.35 
 
 		 292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  38.06 
 
 		 307 aa  166  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  37.23 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1995  transcriptional regulator, XRE family  41.32 
 
 		 313 aa  162  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000234374  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  37.18 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  39.86 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  36.7 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  40.41 
 
 		 277 aa  159  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  39 
 
 		 298 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3700  transcriptional regulator, XRE family  39.48 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.564208  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  35.46 
 
 		 280 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  33.71 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  36.96 
 
 		 280 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  38.79 
 
 		 299 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  35.82 
 
 		 277 aa  155  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  39.6 
 
 		 307 aa  155  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  41.11 
 
 		 285 aa  155  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3299  helix-turn-helix domain protein  38.91 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.043491  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  38.3 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  41.26 
 
 		 285 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  37.74 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  37.84 
 
 		 297 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  35.53 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  38.69 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2718  helix-turn-helix domain protein  37.02 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.479107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4196  transcriptional regulator, XRE family  40.29 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  38.52 
 
 		 257 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  36.72 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  38.65 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  34.43 
 
 		 301 aa  149  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  38.27 
 
 		 285 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3276  transcriptional regulator, XRE family  34.75 
 
 		 281 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  37.19 
 
 		 265 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 288 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4458  transcriptional regulator, XRE family  33.57 
 
 		 272 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1731  hypothetical protein  35.58 
 
 		 296 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  33.79 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1956  putative transcriptional regulator, XRE family  35.51 
 
 		 331 aa  142  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  36.48 
 
 		 259 aa  142  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3598  transcriptional regulator, XRE family  34.22 
 
 		 281 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  28 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  38.38 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 279 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3367  transcriptional regulator, XRE family  33.97 
 
 		 278 aa  139  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>