214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3008 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 303 aa  609  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  88.89 
 
 		 296 aa  526  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  67.71 
 
 		 298 aa  387  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  64.34 
 
 		 293 aa  373  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  64.4 
 
 		 313 aa  362  3e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  62.63 
 
 		 305 aa  347  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  61.35 
 
 		 292 aa  339  4e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  59.57 
 
 		 299 aa  338  5.9999999999999996e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  59.07 
 
 		 293 aa  333  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  54.92 
 
 		 294 aa  316  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  55.83 
 
 		 297 aa  316  4e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  56.58 
 
 		 297 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 304 aa  314  9e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  63.32 
 
 		 303 aa  314  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  56.64 
 
 		 297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  57.69 
 
 		 304 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  55.24 
 
 		 290 aa  312  3.9999999999999997e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  56.23 
 
 		 297 aa  311  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  55.02 
 
 		 299 aa  310  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  55.71 
 
 		 287 aa  305  8.000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  55.17 
 
 		 293 aa  301  7.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  54.96 
 
 		 307 aa  297  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2718  helix-turn-helix domain protein  54.98 
 
 		 308 aa  286  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.479107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  48.53 
 
 		 334 aa  280  3e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  48.42 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  51.38 
 
 		 307 aa  263  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  49.3 
 
 		 303 aa  261  6.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  48.46 
 
 		 297 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  50.9 
 
 		 287 aa  256  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  44.48 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 301 aa  218  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  43.2 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  43.68 
 
 		 303 aa  215  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  42.33 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3299  helix-turn-helix domain protein  44.64 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.043491  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 285 aa  205  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  42.86 
 
 		 276 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  43.68 
 
 		 318 aa  202  7e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  45.05 
 
 		 282 aa  202  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 312 aa  202  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  46.52 
 
 		 275 aa  201  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  41.99 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  45.76 
 
 		 284 aa  198  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  42.24 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  43.12 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  42.39 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  41.99 
 
 		 286 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  40.22 
 
 		 317 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 291 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1995  transcriptional regulator, XRE family  41.7 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000234374  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  43.84 
 
 		 281 aa  183  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  42.5 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  41.2 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  39.72 
 
 		 288 aa  179  7e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 288 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  44.28 
 
 		 288 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  43.17 
 
 		 289 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2579  helix-turn-helix domain protein  37.54 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  40.82 
 
 		 273 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  38.41 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  43.23 
 
 		 284 aa  165  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  43.56 
 
 		 277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4329  transcriptional regulator, XRE family  42.49 
 
 		 290 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  39.7 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  39.37 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  40.39 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1956  putative transcriptional regulator, XRE family  39.01 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  37.09 
 
 		 307 aa  152  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  41.45 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  41.87 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  41.95 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 283 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  36.03 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  38.06 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 299 aa  146  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  37.05 
 
 		 303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  38.25 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  38.25 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 284 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  36.63 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  39.49 
 
 		 285 aa  142  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  37 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  37.25 
 
 		 287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  37.74 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  36.88 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 278 aa  139  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 278 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  37.92 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3276  transcriptional regulator, XRE family  36.06 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  37.06 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3700  transcriptional regulator, XRE family  36.9 
 
 		 273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.564208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 288 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2807  transcriptional regulator, XRE family  35.86 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>