222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2784 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 284 aa  555  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  48.85 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  46.72 
 
 		 278 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  43.27 
 
 		 317 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  45.93 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  47.13 
 
 		 314 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  41.91 
 
 		 302 aa  185  8e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  42.7 
 
 		 273 aa  185  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  45.15 
 
 		 292 aa  185  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  43.07 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  42.39 
 
 		 310 aa  181  9.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  42.44 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  45.17 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  44.61 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  43.63 
 
 		 293 aa  176  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  42.18 
 
 		 287 aa  175  9e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  42.15 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  41.01 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  42.22 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  43.33 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  40.07 
 
 		 290 aa  170  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  42.31 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 312 aa  168  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  42.64 
 
 		 305 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  42.86 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  43.24 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  43.59 
 
 		 286 aa  165  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 263 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  42.91 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  39.7 
 
 		 280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  38.52 
 
 		 276 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  41.9 
 
 		 280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  41.16 
 
 		 291 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  42.59 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  41.07 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  40.29 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  42.25 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  40.15 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  39.72 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3700  transcriptional regulator, XRE family  41.02 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.564208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  41.73 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1995  transcriptional regulator, XRE family  42.8 
 
 		 313 aa  156  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000234374  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  39.26 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  43.08 
 
 		 277 aa  155  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  39.69 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  40.44 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  44.16 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  43.12 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 342 aa  152  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  40.37 
 
 		 299 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  41.76 
 
 		 285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  40.07 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  41.76 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  43.8 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  42.06 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  42.7 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  41.61 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  38.27 
 
 		 303 aa  149  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  43.91 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1269  XRE family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  39.25 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  41.7 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  41.58 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  36.4 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  44.14 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  39 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  41.38 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  36.8 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2182  XRE family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2702  helix-turn-helix domain protein  41.45 
 
 		 284 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3276  transcriptional regulator, XRE family  36.8 
 
 		 281 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  36.5 
 
 		 317 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  37.02 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4329  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  41.25 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3598  transcriptional regulator, XRE family  37.17 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3299  helix-turn-helix domain protein  41.91 
 
 		 280 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.043491  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  35.69 
 
 		 301 aa  139  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>