221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4077 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 275 aa  540  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3367  transcriptional regulator, XRE family  55.76 
 
 		 278 aa  285  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1162  XRE family transcriptional regulator  55.68 
 
 		 281 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157815  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5170  XRE family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.624653  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4269  helix-turn-helix domain protein  50.99 
 
 		 279 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0718578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  43.45 
 
 		 280 aa  204  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  42.75 
 
 		 280 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  42.8 
 
 		 313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  41.92 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  38.11 
 
 		 303 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  41.22 
 
 		 317 aa  185  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 299 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  38.98 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  40.23 
 
 		 283 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  32.57 
 
 		 276 aa  175  9e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0930  helix-turn-helix domain-containing protein  41.43 
 
 		 297 aa  171  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  40.15 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  40.37 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3065  helix-turn-helix domain protein  42.06 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  39.55 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  38.43 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1731  hypothetical protein  37.93 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1066  helix-turn-helix domain-containing protein  39.06 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  39.2 
 
 		 277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  38.38 
 
 		 303 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5755  XRE family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1269  XRE family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  37.08 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  40.78 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 276 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0622  hypothetical protein  38.25 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0773  transcriptional regulator, XRE family  38.25 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1226  putative DNA-binding protein  41.25 
 
 		 271 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.179938  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1067  hypothetical protein  41.25 
 
 		 271 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1073  hypothetical protein  41.25 
 
 		 271 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0725  hypothetical protein  41.25 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0212373  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0869  transcriptional regulator  40.86 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939079  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2807  transcriptional regulator, XRE family  38.74 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2289  hypothetical protein  41.25 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2996  hypothetical protein  41.25 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  36.03 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  39.18 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1603  hypothetical protein  40.86 
 
 		 271 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  40.23 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3292  helix-turn-helix domain protein  36.4 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 278 aa  155  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 285 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 285 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  40.16 
 
 		 278 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 289 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1115  XRE family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3414  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1066  transcriptional regulator, XRE family  39.53 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1431  XRE family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3439  transcriptional regulator, XRE family  35.27 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 285 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2471  XRE family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2337  XRE family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146062 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2182  XRE family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 270 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0866  XRE family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4128  hypothetical protein  38.52 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  38.29 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2362  helix-turn-helix domain-containing protein  40.94 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  35.64 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  36.26 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  37.78 
 
 		 276 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4526  XRE family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1816  XRE family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 269 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2428  XRE family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 269 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2432  XRE family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 269 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.732467  normal  0.678442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47890  hypothetical protein  37.89 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000556405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3211  XRE family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.663604  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2702  helix-turn-helix domain protein  38.83 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  37.09 
 
 		 299 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  36.59 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3547  XRE family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 293 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  37.96 
 
 		 277 aa  145  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1766  helix-turn-helix domain protein  35.74 
 
 		 306 aa  145  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  36.53 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  36.5 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  38.11 
 
 		 278 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 282 aa  142  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  38.01 
 
 		 275 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2768  XRE family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 318 aa  142  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 304 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  37.01 
 
 		 297 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  35.56 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>