214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04290 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  100 
 
 		 334 aa  664    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2718  helix-turn-helix domain protein  59.59 
 
 		 308 aa  312  5.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.479107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  54.64 
 
 		 293 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  53.82 
 
 		 293 aa  288  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  53.15 
 
 		 294 aa  286  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  55.83 
 
 		 299 aa  285  5.999999999999999e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  53.5 
 
 		 298 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  48.53 
 
 		 303 aa  280  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  50.49 
 
 		 292 aa  280  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  51.93 
 
 		 287 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 296 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  51.38 
 
 		 305 aa  275  6e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  51.68 
 
 		 297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  51.17 
 
 		 297 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  48.26 
 
 		 302 aa  272  5.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  53.74 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  51.34 
 
 		 297 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  52.67 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  52.45 
 
 		 293 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  52.46 
 
 		 303 aa  271  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  49.83 
 
 		 304 aa  266  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  50.7 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  52.82 
 
 		 303 aa  249  6e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  46.6 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  46.39 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3299  helix-turn-helix domain protein  50.7 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.043491  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  47.22 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  44.41 
 
 		 297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  45.55 
 
 		 287 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 309 aa  212  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  45.55 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  41.61 
 
 		 303 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  39.03 
 
 		 302 aa  192  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  45.49 
 
 		 275 aa  189  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 285 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  36.94 
 
 		 317 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  44.04 
 
 		 292 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  38.93 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  39.86 
 
 		 276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  39.93 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 289 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  39.93 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 282 aa  175  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  41.54 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 278 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  40.78 
 
 		 284 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 288 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  42.05 
 
 		 288 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  40.81 
 
 		 273 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1995  transcriptional regulator, XRE family  39.24 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000234374  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  41.34 
 
 		 289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  43.02 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  39.07 
 
 		 291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  38.28 
 
 		 286 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  39.35 
 
 		 281 aa  156  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  39.37 
 
 		 291 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  38.57 
 
 		 277 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  38.32 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  36.75 
 
 		 288 aa  152  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  39.02 
 
 		 300 aa  150  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  35.77 
 
 		 280 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4329  transcriptional regulator, XRE family  38.54 
 
 		 290 aa  149  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  38.69 
 
 		 284 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  37.55 
 
 		 257 aa  146  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  40.28 
 
 		 285 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1956  putative transcriptional regulator, XRE family  38.21 
 
 		 331 aa  143  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 285 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  38.66 
 
 		 265 aa  143  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 285 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 285 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  38.79 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  38.25 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2579  helix-turn-helix domain protein  37.19 
 
 		 328 aa  139  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  35.11 
 
 		 280 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  35.5 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3700  transcriptional regulator, XRE family  36.16 
 
 		 273 aa  135  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.564208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  33.67 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  36.59 
 
 		 278 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  32.45 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  35.88 
 
 		 317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  36.92 
 
 		 285 aa  132  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  35.02 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  35.28 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4662  helix-turn-helix domain protein  36.56 
 
 		 287 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>