214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3720 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 297 aa  592  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  57.77 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  54.93 
 
 		 302 aa  294  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 285 aa  294  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  55 
 
 		 298 aa  281  6.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  51.43 
 
 		 293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  52.33 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  52.26 
 
 		 304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  54.48 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  52.41 
 
 		 293 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  54.15 
 
 		 284 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 296 aa  268  8.999999999999999e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  51.64 
 
 		 299 aa  268  8.999999999999999e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  48.46 
 
 		 303 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  51.06 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  52.33 
 
 		 299 aa  258  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  49.32 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  51.89 
 
 		 313 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  50.18 
 
 		 302 aa  246  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  48.92 
 
 		 290 aa  245  8e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  48.75 
 
 		 297 aa  244  9e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  48.57 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  52 
 
 		 292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  46.48 
 
 		 287 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  46.53 
 
 		 293 aa  239  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  48.23 
 
 		 310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  48.94 
 
 		 307 aa  232  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  46.15 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  45.61 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  44.88 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2718  helix-turn-helix domain protein  48.8 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.479107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  45.36 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  48.37 
 
 		 303 aa  223  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  43.57 
 
 		 299 aa  222  6e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  49.81 
 
 		 282 aa  221  8e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  47.37 
 
 		 318 aa  219  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  46.93 
 
 		 303 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  48.01 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1995  transcriptional regulator, XRE family  47.9 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000234374  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  42.96 
 
 		 317 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 289 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  40.22 
 
 		 276 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3299  helix-turn-helix domain protein  48.75 
 
 		 280 aa  205  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.043491  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 289 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 289 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  46.62 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  45.82 
 
 		 314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  46.18 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  44.36 
 
 		 291 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2579  helix-turn-helix domain protein  45.29 
 
 		 328 aa  195  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  41.7 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  43.17 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  43.31 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 278 aa  192  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  43.36 
 
 		 280 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 342 aa  185  8e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  46.64 
 
 		 275 aa  185  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  42.58 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4329  transcriptional regulator, XRE family  45.04 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  44.21 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  44.84 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  44.12 
 
 		 265 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  43.54 
 
 		 273 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  44.93 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  43.68 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  41.64 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2807  transcriptional regulator, XRE family  40.7 
 
 		 258 aa  172  7.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  43.84 
 
 		 289 aa  168  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  44.07 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 278 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1956  putative transcriptional regulator, XRE family  41.45 
 
 		 331 aa  166  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  41.55 
 
 		 281 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  42.55 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  38.58 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  40.75 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  41.57 
 
 		 277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  38.82 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  43.87 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  40.23 
 
 		 275 aa  158  9e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 276 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  40.15 
 
 		 265 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 284 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  40.78 
 
 		 278 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  42.65 
 
 		 311 aa  155  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0902  XRE family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  40.66 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  39.39 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  38.52 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>