228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4361 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 265 aa  519  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  48.86 
 
 		 275 aa  212  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  45.05 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  41.6 
 
 		 273 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  48.63 
 
 		 277 aa  170  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 288 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  45.38 
 
 		 288 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  45.38 
 
 		 289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  41.39 
 
 		 302 aa  165  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  39.18 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  41.04 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  41.57 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  41.33 
 
 		 293 aa  158  7e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  39.78 
 
 		 297 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  42.12 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  40.36 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  42.12 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 285 aa  156  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  40.38 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  41.9 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  41.33 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  41.45 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  43.43 
 
 		 286 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  39.42 
 
 		 299 aa  149  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  39.02 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3700  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.564208  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  40.66 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  39.1 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  37.19 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  36.88 
 
 		 307 aa  145  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 289 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 289 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 289 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  40.07 
 
 		 294 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 299 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  40.3 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  38.66 
 
 		 334 aa  143  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  37.32 
 
 		 310 aa  142  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  39.93 
 
 		 281 aa  142  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  38.46 
 
 		 297 aa  142  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  38.95 
 
 		 276 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  38.93 
 
 		 307 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  37.02 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  40.73 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  39.27 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  38.29 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  39.37 
 
 		 307 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  36.64 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  38.6 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  39.34 
 
 		 303 aa  135  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 342 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  37.68 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  38.87 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 283 aa  132  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  37.22 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1997  transcriptional regulator, XRE family  39.37 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  39.78 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  37.59 
 
 		 300 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  37.59 
 
 		 292 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  37.45 
 
 		 275 aa  126  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3299  helix-turn-helix domain protein  39.19 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.043491  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4329  transcriptional regulator, XRE family  39.11 
 
 		 290 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  37.08 
 
 		 297 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  35.61 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0208  XRE family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.138367 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  34.55 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  36.47 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2718  helix-turn-helix domain protein  37.27 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.479107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  32.82 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1995  transcriptional regulator, XRE family  38.77 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000234374  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2807  transcriptional regulator, XRE family  39.04 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  41.18 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 279 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 284 aa  118  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  37.08 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0902  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3439  transcriptional regulator, XRE family  33.47 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3292  helix-turn-helix domain protein  33.73 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4458  transcriptional regulator, XRE family  36.19 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  38.15 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  40.22 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3153  transcriptional regulator, XRE family  39.18 
 
 		 290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1431  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 303 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  33.73 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2377  transcriptional regulator, XRE family  37.27 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000201287  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7525  helix-turn-helix domain protein  32.08 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>