225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0313 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  591  1e-168  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  71.38 
 
 		 279 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  65.93 
 
 		 278 aa  375  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  67.04 
 
 		 274 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  67.15 
 
 		 278 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  66.54 
 
 		 278 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  65.02 
 
 		 295 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  67.04 
 
 		 276 aa  360  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  64.15 
 
 		 277 aa  351  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  64.64 
 
 		 284 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  62.45 
 
 		 285 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  64.31 
 
 		 289 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  62.45 
 
 		 285 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  61.71 
 
 		 285 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  60.22 
 
 		 285 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3547  XRE family transcriptional regulator  63.2 
 
 		 293 aa  298  7e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0902  XRE family transcriptional regulator  54.07 
 
 		 284 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  43.98 
 
 		 280 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  43.18 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  40.89 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 283 aa  188  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  39.92 
 
 		 259 aa  182  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  40.07 
 
 		 283 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  41.11 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  40.56 
 
 		 265 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  42.13 
 
 		 275 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1269  XRE family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3367  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  40.84 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  43.23 
 
 		 281 aa  168  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 297 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  39.86 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  30.48 
 
 		 276 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1162  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 281 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157815  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 285 aa  165  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  37.6 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  38.32 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4269  helix-turn-helix domain protein  39.44 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0718578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  39.41 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  37.59 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  38.74 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 289 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  40.94 
 
 		 278 aa  159  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  37.45 
 
 		 287 aa  159  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5170  XRE family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 280 aa  159  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.624653  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 288 aa  158  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3439  transcriptional regulator, XRE family  36.29 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  38.85 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 289 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 289 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  36.73 
 
 		 302 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1731  hypothetical protein  36.62 
 
 		 296 aa  155  7e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3065  helix-turn-helix domain protein  39.92 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  39.05 
 
 		 284 aa  155  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  37.06 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5755  XRE family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  37.55 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2807  transcriptional regulator, XRE family  38.65 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1115  XRE family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  38.58 
 
 		 299 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  37.92 
 
 		 297 aa  152  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3292  helix-turn-helix domain protein  35.89 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  39.22 
 
 		 277 aa  152  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  39.84 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  37.05 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  38.43 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  37.97 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  37.63 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3211  XRE family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 263 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.663604  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0025  helix-turn-helix domain protein  40.88 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1066  helix-turn-helix domain-containing protein  35.79 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0038  helix-turn-helix domain protein  40.15 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2728  DNA-binding protein  35.58 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  38.63 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  37.55 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  38.29 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  37.09 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  37.92 
 
 		 294 aa  146  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2362  helix-turn-helix domain-containing protein  40.24 
 
 		 257 aa  146  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 263 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3414  XRE family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 270 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 304 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 296 aa  145  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2182  XRE family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 270 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 282 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  35.42 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  39.31 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4128  hypothetical protein  37.26 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 278 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4188  transcriptional regulator, XRE family  36.88 
 
 		 298 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  35.86 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  34.66 
 
 		 282 aa  142  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>