221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3997 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 278 aa  558  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  67.16 
 
 		 277 aa  384  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  70.26 
 
 		 274 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  70.26 
 
 		 278 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  65.93 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  66.79 
 
 		 278 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  66.79 
 
 		 295 aa  371  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  69.4 
 
 		 276 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  65.54 
 
 		 279 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 284 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  61.99 
 
 		 289 aa  330  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  61.62 
 
 		 285 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  61.62 
 
 		 285 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  61.25 
 
 		 285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  60.89 
 
 		 285 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3547  XRE family transcriptional regulator  61.99 
 
 		 293 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0902  XRE family transcriptional regulator  53 
 
 		 284 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  40.67 
 
 		 280 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  42.19 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  42.29 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  38.64 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 283 aa  172  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  40.55 
 
 		 313 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  32.73 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  40.07 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 285 aa  165  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  39.92 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  39.48 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  35.36 
 
 		 283 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 276 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1269  XRE family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 264 aa  160  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3439  transcriptional regulator, XRE family  38.31 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3292  helix-turn-helix domain protein  37.9 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  35.5 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5755  XRE family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 269 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1162  XRE family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157815  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  37.12 
 
 		 309 aa  151  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  36.12 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  39.05 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  35.66 
 
 		 280 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  37.6 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3367  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  38.89 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  36.5 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  36.29 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4128  hypothetical protein  35.91 
 
 		 287 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  35.71 
 
 		 302 aa  146  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  36.15 
 
 		 298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2182  XRE family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3211  XRE family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.663604  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  38.34 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  35.21 
 
 		 287 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  35.09 
 
 		 293 aa  142  9e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  32.69 
 
 		 303 aa  141  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1066  transcriptional regulator, XRE family  38.8 
 
 		 270 aa  142  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  37.92 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3414  XRE family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4269  helix-turn-helix domain protein  35.56 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0718578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2471  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3065  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1995  transcriptional regulator, XRE family  37.69 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000234374  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5170  XRE family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.624653  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0716  hypothetical protein  40 
 
 		 260 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0866  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2337  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146062 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0869  transcriptional regulator  40.73 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939079  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1731  hypothetical protein  34.66 
 
 		 296 aa  139  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0725  hypothetical protein  40.73 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0212373  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2289  hypothetical protein  40.73 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2996  hypothetical protein  40.73 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  35.96 
 
 		 303 aa  139  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1816  XRE family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 269 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2428  XRE family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 269 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2432  XRE family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 269 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.732467  normal  0.678442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47890  hypothetical protein  36.02 
 
 		 314 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000556405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1603  hypothetical protein  40.32 
 
 		 271 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1226  putative DNA-binding protein  40.32 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.179938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  32.85 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1067  hypothetical protein  40.32 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1073  hypothetical protein  40.32 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1007  XRE family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  34.3 
 
 		 318 aa  136  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  38.14 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0038  helix-turn-helix domain protein  39.45 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3276  transcriptional regulator, XRE family  35.34 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  34.62 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0023  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 301 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 288 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1766  helix-turn-helix domain protein  34.3 
 
 		 306 aa  135  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0025  helix-turn-helix domain protein  39.45 
 
 		 300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1431  XRE family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  34.19 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  34.26 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  34.78 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  33.21 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3598  transcriptional regulator, XRE family  35.58 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>