211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2575 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2575  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 280 aa  558  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2366  transcriptional regulator, XRE family  74.82 
 
 		 279 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0700  transcriptional regulator, XRE family  73.63 
 
 		 279 aa  408  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1333  transcriptional regulator, XRE family  74.45 
 
 		 279 aa  407  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4188  transcriptional regulator, XRE family  71.17 
 
 		 298 aa  395  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4173  transcriptional regulator, XRE family  72.04 
 
 		 280 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4040  helix-turn-helix domain protein  72.1 
 
 		 300 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557153  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4458  transcriptional regulator, XRE family  58.46 
 
 		 272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3112  helix-turn-helix domain protein  55.68 
 
 		 279 aa  289  3e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000518579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2024  putative transcriptional regulator, XRE family  55.2 
 
 		 286 aa  285  5e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1062  XRE family transcriptional regulator  57.99 
 
 		 289 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4999  transcriptional regulator, XRE family  52.22 
 
 		 301 aa  264  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.662496 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  54.01 
 
 		 280 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3573  helix-turn-helix domain-containing protein  53.48 
 
 		 281 aa  249  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4662  helix-turn-helix domain protein  51.09 
 
 		 287 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  49.64 
 
 		 287 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1305  XRE family transcriptional regulator  48.13 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  43.77 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2374  helix-turn-helix domain-containing protein  46.52 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.171601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1995  helix-turn-helix domain protein  46.51 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  40.58 
 
 		 281 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 278 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2377  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000201287  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3153  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  39.13 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  37.96 
 
 		 285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4588  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000221272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  39.5 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4035  transcriptional regulator, XRE family  36.63 
 
 		 326 aa  141  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808008  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 282 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6085  transcriptional regulator, XRE family  36.57 
 
 		 291 aa  128  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.126069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  35.85 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  37.01 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  35.02 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 285 aa  125  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 314 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  35.51 
 
 		 303 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  33.94 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  35.69 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  35.34 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  35.61 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  34.39 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  34.89 
 
 		 289 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  34.89 
 
 		 288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  32.41 
 
 		 290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  33.94 
 
 		 276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  34.55 
 
 		 280 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  33.21 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  34.98 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 299 aa  112  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  34.53 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  34.67 
 
 		 307 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  32.86 
 
 		 334 aa  112  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  34.66 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  34.04 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  33.57 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  35.38 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  35.56 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  32.32 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  34.51 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2702  helix-turn-helix domain protein  34.56 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  34.67 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 285 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  33.45 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  34.32 
 
 		 280 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  36.03 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1066  helix-turn-helix domain-containing protein  33.68 
 
 		 289 aa  106  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  32.94 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  32.25 
 
 		 293 aa  105  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  34.32 
 
 		 277 aa  105  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  33.68 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  31.88 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3065  helix-turn-helix domain protein  42.58 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  33.46 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  33.45 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  27.8 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  32.22 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  32.57 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  35.13 
 
 		 305 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1431  XRE family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 303 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1731  hypothetical protein  33.45 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>