213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4588 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4588  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 286 aa  570  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000221272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2377  transcriptional regulator, XRE family  49.63 
 
 		 283 aa  212  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000201287  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4035  transcriptional regulator, XRE family  49.26 
 
 		 326 aa  208  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808008  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3153  transcriptional regulator, XRE family  45.94 
 
 		 290 aa  194  9e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6085  transcriptional regulator, XRE family  45.42 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.126069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  42.81 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2980  transcriptional regulator, XRE family  43.56 
 
 		 271 aa  171  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.239716  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  41.49 
 
 		 281 aa  165  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  42.65 
 
 		 278 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  41.79 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4662  helix-turn-helix domain protein  38.68 
 
 		 287 aa  162  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2366  transcriptional regulator, XRE family  39.64 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2024  putative transcriptional regulator, XRE family  43.21 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3904  transcriptional regulator, XRE family  41.16 
 
 		 284 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494464  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0700  transcriptional regulator, XRE family  40.86 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1333  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 279 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4188  transcriptional regulator, XRE family  40.36 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2210  putative transcriptional regulator, XRE family  40.15 
 
 		 312 aa  149  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2575  helix-turn-helix domain protein  38.57 
 
 		 280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1305  XRE family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  38.71 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4458  transcriptional regulator, XRE family  38.63 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  37.19 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  40.14 
 
 		 285 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  39.36 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  38.99 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  40.14 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3573  helix-turn-helix domain-containing protein  39.86 
 
 		 281 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  37.86 
 
 		 303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1995  helix-turn-helix domain protein  41.28 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2374  helix-turn-helix domain-containing protein  40.36 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.171601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  36.23 
 
 		 303 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  38.63 
 
 		 275 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  38.63 
 
 		 285 aa  132  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  36.17 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4999  transcriptional regulator, XRE family  37.87 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.662496 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3112  helix-turn-helix domain protein  40.36 
 
 		 279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000518579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  39.21 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  37.77 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  34.97 
 
 		 317 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  37.01 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 282 aa  128  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  35 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  34.03 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  35.13 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4040  helix-turn-helix domain protein  39.44 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557153  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4173  transcriptional regulator, XRE family  35.87 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  32.58 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  34.93 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  36.63 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  34.07 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1062  XRE family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  34.6 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  35.11 
 
 		 286 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  33.92 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  35.34 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  35.32 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  37.2 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  35.19 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  32.37 
 
 		 302 aa  116  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  34.63 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  34.91 
 
 		 304 aa  115  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  35.93 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  36.07 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  34.84 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  36.07 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  33.69 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  35.5 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  37.36 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  33.57 
 
 		 318 aa  112  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  34.41 
 
 		 293 aa  108  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 289 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  35.5 
 
 		 313 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3065  helix-turn-helix domain protein  33.98 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  35.17 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5170  XRE family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.624653  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  35.29 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  35.66 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  32.73 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 289 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 289 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  34.19 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3367  transcriptional regulator, XRE family  32.1 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  32.85 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  32.21 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  33.7 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1162  XRE family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 281 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157815  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  34.09 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>