214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2210 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2210  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 312 aa  617  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3904  transcriptional regulator, XRE family  75.09 
 
 		 284 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494464  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4588  XRE family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000221272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2980  transcriptional regulator, XRE family  37.17 
 
 		 271 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.239716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  35.27 
 
 		 278 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3153  transcriptional regulator, XRE family  37.41 
 
 		 290 aa  119  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  37.99 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2377  transcriptional regulator, XRE family  35.63 
 
 		 283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000201287  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  35.04 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  34.77 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4035  transcriptional regulator, XRE family  36.9 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808008  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  40.28 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  35.25 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6085  transcriptional regulator, XRE family  34.2 
 
 		 291 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.126069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  33.97 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  31.23 
 
 		 302 aa  92.8  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  32.09 
 
 		 292 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  31.58 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4458  transcriptional regulator, XRE family  30.11 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4999  transcriptional regulator, XRE family  29.55 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.662496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  32.58 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1995  helix-turn-helix domain protein  37.04 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  33.21 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  36.04 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  31.14 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2024  putative transcriptional regulator, XRE family  33.46 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4662  helix-turn-helix domain protein  35.98 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 282 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  32.47 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  37.1 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  36.04 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3112  helix-turn-helix domain protein  32.72 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000518579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  30.83 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  30.92 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  31.01 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  34.27 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  33.89 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  30.43 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1305  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1062  XRE family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7525  helix-turn-helix domain protein  29.45 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  31.41 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4188  transcriptional regulator, XRE family  30.57 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2575  helix-turn-helix domain protein  27.44 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0700  transcriptional regulator, XRE family  32.21 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  31.38 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 263 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  34.29 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  33.09 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  32.34 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  34.57 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  27.84 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1431  XRE family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  34.91 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  27.65 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  34.26 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2366  transcriptional regulator, XRE family  27.92 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  30.11 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  32.73 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  33.98 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  32.86 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1162  XRE family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157815  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  33.47 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1066  helix-turn-helix domain-containing protein  29.91 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  30.07 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  31.84 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  29.75 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  30.11 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  30.6 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3367  transcriptional regulator, XRE family  28.98 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0716  hypothetical protein  33.85 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  32.82 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  32.09 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  31.92 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3547  XRE family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  30.94 
 
 		 334 aa  68.9  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2768  XRE family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>