212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4128 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4128  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  584  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47890  hypothetical protein  95.47 
 
 		 314 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000556405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1431  XRE family transcriptional regulator  58.3 
 
 		 303 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1766  helix-turn-helix domain protein  54.17 
 
 		 306 aa  316  4e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1731  hypothetical protein  55.8 
 
 		 296 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1066  helix-turn-helix domain-containing protein  55.07 
 
 		 289 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  44.2 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  42.59 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2702  helix-turn-helix domain protein  42.55 
 
 		 284 aa  185  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3065  helix-turn-helix domain protein  41.73 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  40.23 
 
 		 287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0716  hypothetical protein  42.5 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  39.34 
 
 		 280 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  37.88 
 
 		 280 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  38.78 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3367  transcriptional regulator, XRE family  36.19 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0930  helix-turn-helix domain-containing protein  41.1 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  33.94 
 
 		 303 aa  152  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  38.13 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  36.57 
 
 		 277 aa  147  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  37.69 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 276 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  34.38 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 259 aa  142  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  31.91 
 
 		 276 aa  142  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2768  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7525  helix-turn-helix domain protein  36.36 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  35.04 
 
 		 274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  35.77 
 
 		 283 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5170  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.624653  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  34.65 
 
 		 278 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  36.61 
 
 		 292 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  38.03 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3211  XRE family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.663604  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  35.27 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1269  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 264 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4269  helix-turn-helix domain protein  34.17 
 
 		 279 aa  128  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0718578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  36.06 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5755  XRE family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 269 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2807  transcriptional regulator, XRE family  36.19 
 
 		 258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  34.1 
 
 		 310 aa  125  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1162  XRE family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 281 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157815  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3547  XRE family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  34.77 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  33.97 
 
 		 292 aa  122  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  37.74 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0025  helix-turn-helix domain protein  34.7 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3276  transcriptional regulator, XRE family  35.02 
 
 		 281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0038  helix-turn-helix domain protein  32.87 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  37.07 
 
 		 314 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2182  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0622  hypothetical protein  33.59 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0773  transcriptional regulator, XRE family  33.59 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  34.71 
 
 		 293 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2471  XRE family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 269 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2337  XRE family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 269 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  35.29 
 
 		 286 aa  118  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1066  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0866  XRE family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1816  XRE family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 269 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2428  XRE family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 269 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3414  XRE family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  36.82 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 288 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  36.5 
 
 		 288 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0869  transcriptional regulator  34.2 
 
 		 271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939079  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0023  XRE family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 301 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3598  transcriptional regulator, XRE family  33.22 
 
 		 281 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  32.59 
 
 		 291 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1226  putative DNA-binding protein  34.72 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.179938  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1067  hypothetical protein  34.72 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1073  hypothetical protein  34.72 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2432  XRE family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.732467  normal  0.678442 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0902  XRE family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3292  helix-turn-helix domain protein  32.82 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0725  hypothetical protein  34.34 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0212373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2289  hypothetical protein  34.34 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2996  hypothetical protein  34.34 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4526  XRE family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  34.57 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  32.82 
 
 		 292 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1603  hypothetical protein  33.96 
 
 		 271 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2024  putative transcriptional regulator, XRE family  38.28 
 
 		 286 aa  112  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>