212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_47890 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_47890  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  638    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000556405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4128  hypothetical protein  95.47 
 
 		 287 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1431  XRE family transcriptional regulator  56.83 
 
 		 303 aa  324  9e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1731  hypothetical protein  53.82 
 
 		 296 aa  309  5e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1766  helix-turn-helix domain protein  52.76 
 
 		 306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1066  helix-turn-helix domain-containing protein  54.71 
 
 		 289 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 		 313 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  41.44 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2702  helix-turn-helix domain protein  41.67 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3065  helix-turn-helix domain protein  41.35 
 
 		 276 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0716  hypothetical protein  42.97 
 
 		 260 aa  178  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  38.87 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  38.93 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  37.88 
 
 		 280 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  38.02 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0930  helix-turn-helix domain-containing protein  40.17 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3367  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  30.08 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 283 aa  143  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  35.79 
 
 		 277 aa  143  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 285 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 285 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  33.59 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  37.01 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2768  XRE family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 318 aa  139  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7525  helix-turn-helix domain protein  35.71 
 
 		 294 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 289 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 276 aa  138  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  39.09 
 
 		 283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  32.17 
 
 		 259 aa  135  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  38.14 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 274 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1269  XRE family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 278 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3211  XRE family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 263 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.663604  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  36.26 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5170  XRE family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.624653  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4269  helix-turn-helix domain protein  34.85 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0718578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1162  XRE family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 281 aa  126  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157815  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2807  transcriptional regulator, XRE family  35.41 
 
 		 258 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  34.81 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  34.89 
 
 		 287 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3547  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 279 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2182  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  36.23 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  35.86 
 
 		 293 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5755  XRE family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 269 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 282 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  37.6 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0038  helix-turn-helix domain protein  33.79 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3276  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0622  hypothetical protein  32.42 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  31.62 
 
 		 302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0025  helix-turn-helix domain protein  34.81 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0773  transcriptional regulator, XRE family  32.42 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  33.95 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0902  XRE family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 263 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 263 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  32.68 
 
 		 292 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  35.91 
 
 		 314 aa  115  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1066  transcriptional regulator, XRE family  33.21 
 
 		 270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3414  XRE family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 270 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1007  XRE family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  34.12 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  34.93 
 
 		 289 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2471  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  34.49 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2337  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146062 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3598  transcriptional regulator, XRE family  32.18 
 
 		 281 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1115  XRE family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0866  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 269 aa  112  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1226  putative DNA-binding protein  34.23 
 
 		 271 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.179938  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0023  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1067  hypothetical protein  34.23 
 
 		 271 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1073  hypothetical protein  34.23 
 
 		 271 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4526  XRE family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421002  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0725  hypothetical protein  33.85 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0212373  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0869  transcriptional regulator  33.83 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939079  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3292  helix-turn-helix domain protein  32.44 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2289  hypothetical protein  33.85 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2996  hypothetical protein  33.85 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  33.45 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1816  XRE family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2428  XRE family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  32.3 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>