120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0770 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 262 aa  529  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  52.9 
 
 		 264 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 285 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  52.96 
 
 		 313 aa  269  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  52.57 
 
 		 288 aa  268  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  52.55 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  53.75 
 
 		 271 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  53.28 
 
 		 274 aa  265  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 310 aa  262  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 282 aa  262  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  51.78 
 
 		 268 aa  260  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 282 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  51.36 
 
 		 282 aa  258  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  51.57 
 
 		 282 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  51.57 
 
 		 282 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  53.81 
 
 		 273 aa  255  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  51.57 
 
 		 282 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  51.76 
 
 		 284 aa  255  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  51.57 
 
 		 282 aa  254  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 306 aa  254  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  49.8 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  49.6 
 
 		 271 aa  250  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  51.65 
 
 		 275 aa  249  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 273 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  50.2 
 
 		 272 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  50.2 
 
 		 272 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 267 aa  241  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 267 aa  238  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  51.63 
 
 		 271 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  51.63 
 
 		 271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  51.08 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  49.8 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  47.86 
 
 		 273 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  50.21 
 
 		 273 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 270 aa  228  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  48.82 
 
 		 269 aa  228  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  48.58 
 
 		 273 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  47.15 
 
 		 281 aa  211  7.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  44.86 
 
 		 284 aa  209  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  49.15 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 288 aa  205  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  42.8 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  48.78 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  44.63 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  44.18 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 305 aa  185  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  40.15 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  38.31 
 
 		 276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  37.26 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 277 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 241 aa  152  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  34.31 
 
 		 318 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  36.06 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 272 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1786  helix-turn-helix transcriptional regulator  42.31 
 
 		 124 aa  49.7  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  43.48 
 
 		 488 aa  49.3  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7525  helix-turn-helix domain protein  30.91 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0924  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  36.76 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325541  normal  0.296459 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 130 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2269  helix-turn-helix domain-containing protein  60 
 
 		 48 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 204 aa  46.6  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  36.67 
 
 		 469 aa  45.8  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 218 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 475 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 145 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0773  transcriptional regulator, XRE family  25.95 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0622  hypothetical protein  25.95 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 171 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1649  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 108 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000457933  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  32 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 101 aa  43.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 201 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 178 aa  43.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1080  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 83 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 106 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  38.98 
 
 		 192 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1388  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 119 aa  42.7  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 192 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 66 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 66 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 66 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>